Global justering

Globale justeringsverktøy skaper en end-to-end-justering av sekvensene som skal justeres.

Needle (EMBOSS)

EMBOSS Needle skaper en optimal global justering av to sekvenser ved bruk av Needleman-Wunsch-algoritmen.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher bruker en modifisering av Needleman-Wunsch-algoritmen som gjør det mulig å justere større sekvenser globalt.

Start båre

Lokal justering

Lokale justeringsverktøy finner en eller flere justeringer som beskriver de mest like regionene i sekvensene som skal justeres. De kan justere protein- og nukleotidsekvenser.

Vann (EMBOSS)

EMBOSS Water bruker Smith-Waterman-algoritmen (modifisert for hastighetsforbedringer) for å beregne den lokale justeringen av to sekvenser.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identifiserer lokale likheter mellom to sekvenser ved hjelp av en streng algoritme basert på LALIGN-applikasjonen.

Launch Matcher

LALIGN

LALIGN finner interne duplikasjoner ved å beregne ikke-kryssende lokale justeringer av protein eller DNA-sekvenser.

Start LALIGN