Global inriktning

Globala inriktningsverktyg skapar en änd-till-slut-inriktning av sekvenserna som ska justeras.

Nål (EMBOSS)

EMBOSS Nål skapar en optimal global inriktning av två sekvenser med hjälp av algoritmen Needleman-Wunsch.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher använder en modifiering av Needleman-Wunsch-algoritmen som gör att större sekvenser kan justeras globalt.

Starta sträckare

Lokal inriktning

Lokala inriktningsverktyg hittar en eller flera inriktningar som beskriver de mest regionerna i de sekvenser som ska justeras. De är i linje med protein- och nukleotidsekvenser.

Vatten (EMBOSS)

EMBOSS Water använder Smith-Waterman-algoritmen (modifierad för hastighetsförbättringar) för att beräkna den lokala inriktningen av två sekvenser.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identifierar lokala likheter mellan två sekvenser med hjälp av en rigorös algoritm baserad på LALIGN-applikationen.

Launch Matcher

LALIGN

LALIGN hittar interna duplikationer genom att beräkna icke-korsande lokala inriktningar av protein- eller DNA-sekvenser.

Starta LALIGN