Alineación global

Las herramientas de alineación global crean una alineación de extremo a extremo de las secuencias a alinear.

Needle (EMBOSS)

EMBOSS Needle crea una alineación global óptima de dos secuencias utilizando el algoritmo Needleman-Wunsch.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher utiliza una modificación del algoritmo Needleman-Wunsch que permite alinear globalmente secuencias más grandes.

Ejecutar Stretcher

Alineación local

Las herramientas de alineación local encuentran una o más alineaciones que describen las regiones más similares dentro de las secuencias a alinear. Pueden alinear secuencias de proteínas y nucleótidos.

Agua (EMBOSS)

EMBOSS Water utiliza el algoritmo Smith-Waterman (modificado para mejorar la velocidad) para calcular la alineación local de dos secuencias.

Iniciar Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identifica similitudes locales entre dos secuencias utilizando un algoritmo riguroso basado en la aplicación LALIGN.

Launch Matcher

LALIGN

LALIGN encuentra duplicaciones internas calculando alineaciones locales que no se cruzan de secuencias de proteínas o ADN.

Inicie LALIGN