Alinhamento global

As ferramentas de alinhamento global criam um alinhamento de ponta a ponta das sequências a serem alinhadas.

Needle (EMBOSS)

O EMBOSS Needle cria um alinhamento global ideal de duas sequências usando o algoritmo Needleman-Wunsch.

Lançamento da agulha

Maca (EMBOSS)

A Maca EMBOSS usa uma modificação do algoritmo Needleman-Wunsch que permite que sequências maiores sejam globalmente alinhadas.

Lance o esticador

Alinhamento local

As ferramentas de alinhamento local encontram um ou mais alinhamentos que descrevem a (s) região (ões) mais semelhante (s) nas sequências a serem alinhadas. Eles podem alinhar sequências de proteínas e nucleotídeos.

Water (EMBOSS)

O EMBOSS Water usa o algoritmo Smith-Waterman (modificado para aumentar a velocidade) para calcular o alinhamento local de duas sequências.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

O EMBOSS Matcher identifica semelhanças locais entre duas sequências usando um algoritmo rigoroso baseado no aplicativo LALIGN.

Lançar Matcher

LALIGN

LALIGN encontra duplicações internas calculando alinhamentos locais sem intersecção de proteínas ou sequências de DNA.

Lance o LALIGN