グローバルアラインメント

グローバルアラインメントツールは、アラインメントする配列のエンドツーエンドアラインメントを作成します。

Needle（EMBOSS）

EMBOSS Needleは、Needleman-Wunschアルゴリズムを使用して、2つのシーケンスの最適なグローバルアラインメントを作成します。

発射針

ストレッチャー（EMBOSS）

EMBOSSストレッチャーは、より大きな配列をグローバルに整列させることができるニードルマン-ブンシュアルゴリズムの修正を使用します。

ストレッチャーの起動

ローカルアラインメント

ローカルアラインメントツールは、アラインメントするシーケンス内で最も類似した領域を表す1つ以上のアラインメントを検索します。それらはタンパク質とヌクレオチド配列を整列させることができます。

Water（EMBOSS）

EMBOSS Waterは、Smith-Watermanアルゴリズム（速度向上のために変更）を使用して、2つのシーケンスのローカルアラインメントを計算します。

Launch Water

マッチャー（EMBOSS）

EMBOSSマッチャーは、LALIGNアプリケーションに基づく厳密なアルゴリズムを使用して、2つのシーケンス間の局所的な類似性を識別します。

ローンチマッチャー

LALIGN

LALIGNは、タンパク質またはDNA配列の交差しないローカルアラインメントを計算することにより、内部重複を検出します。

LALIGNを起動します