Alinierea globală

Instrumentele de aliniere globală creează o aliniere cap la cap a secvențelor care urmează să fie aliniate.

Needle (EMBOSS)

EMBOSS Needle creează o aliniere globală optimă a două secvențe utilizând algoritmul Needleman-Wunsch.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher folosește o modificare a algoritmului Needleman-Wunsch care permite alinierea secvențelor mai mari la nivel global.

Launch Stretcher

Alinierea locală

Instrumentele de aliniere locală găsesc una sau mai multe alinieri care descriu cele mai similare regiuni din secvențele care trebuie aliniate. Acestea pot alinia secvențele de proteine și nucleotide.

Water (EMBOSS)

EMBOSS Water folosește algoritmul Smith-Waterman (modificat pentru îmbunătățirea vitezei) pentru a calcula alinierea locală a două secvențe.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identifică asemănările locale între două secvențe utilizând un algoritm riguros bazat pe aplicația LALIGN.

Launch Matcher

LALIGN

LALIGN găsește duplicări interne prin calcularea alinierilor locale care nu se intersectează de secvențe de proteine sau ADN.

Lansați LALIGN