페어 와이즈 시퀀스 정렬


글로벌 정렬

글로벌 정렬 도구는 정렬 할 시퀀스의 종단 간 정렬을 만듭니다.

Needle (EMBOSS)

EMBOSS Needle은 Needleman-Wunsch 알고리즘을 사용하여 두 시퀀스의 최적 전역 정렬을 생성합니다.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher는 더 큰 시퀀스를 전체적으로 정렬 할 수있는 Needleman-Wunsch 알고리즘의 수정을 사용합니다.

스트 레처 시작

로컬 정렬

로컬 정렬 도구는 정렬 할 시퀀스 내에서 가장 유사한 영역을 설명하는 하나 이상의 정렬을 찾습니다. 그들은 단백질과 뉴클레오티드 서열을 정렬 할 수 있습니다.

Water (EMBOSS)

EMBOSS Water는 Smith-Waterman 알고리즘 (속도 향상을 위해 수정 됨)을 사용하여 두 시퀀스의 로컬 정렬을 계산합니다.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher는 LALIGN 응용 프로그램을 기반으로하는 엄격한 알고리즘을 사용하여 두 시퀀스 간의 로컬 유사성을 식별합니다.

Launch Matcher

LALIGN

LALIGN은 단백질 또는 DNA 서열의 교차하지 않는 로컬 정렬을 계산하여 내부 중복을 찾습니다.

LALIGN 시작

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