Globális igazítás

A globális igazítóeszközök egymáshoz igazítják az igazítandó szekvenciákat.

Tű (EMBOSS)

Az EMBOSS Tű a Needleman-Wunsch algoritmus segítségével két szekvencia optimális globális igazítását hozza létre.

Tű indítása

Stretcher (EMBOSS)

Az EMBOSS Stretcher a Needleman-Wunsch algoritmus módosítását használja, amely lehetővé teszi a nagyobb szekvenciák globális összehangolását.

Indítsa el a Stretchert

Helyi igazítás

A helyi igazítási eszközök találnak egy vagy több olyan igazítást, amely leírja az igazítandó szekvenciákon belül a leginkább hasonló régió (ka) t. Ezek igazíthatják a fehérje és a nukleotid szekvenciákat.

Víz (EMBOSS)

Az EMBOSS A víz a Smith-Waterman algoritmust használja (a sebességnöveléshez módosítva) két szekvencia helyi igazításának kiszámításához.

Víz indítása

Matcher (EMBOSS)

Az EMBOSS Matcher a LALIGN alkalmazáson alapuló szigorú algoritmus segítségével azonosítja két szekvencia helyi hasonlóságát.

A Matcher indítása

LALIGN

A LALIGN belső duplikációkat talál a fehérje vagy a DNS szekvenciák nem metsző helyi illesztéseinek kiszámításával.

Indítsa el a LALIGN

alkalmazást