Globale Ausrichtung

Globale Ausrichtungswerkzeuge erstellen eine End-to-End-Ausrichtung der auszurichtenden Sequenzen.

Nadel (EMBOSS)

EMBOSS Nadel erzeugt mithilfe des Needleman-Wunsch-Algorithmus eine optimale globale Ausrichtung zweier Sequenzen.

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Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher verwendet eine Modifikation des Needleman-Wunsch-Algorithmus, mit der größere Sequenzen global ausgerichtet werden können.

Startbahre

Lokale Ausrichtung

Lokale Ausrichtungswerkzeuge finden eine oder mehrere Ausrichtungen, die die ähnlichsten Bereiche innerhalb der auszurichtenden Sequenzen beschreiben. Sie können Protein- und Nukleotidsequenzen ausrichten.

Wasser (EMBOSS)

EMBOSS Wasser verwendet den Smith-Waterman-Algorithmus (modifiziert für Geschwindigkeitsverbesserungen), um die lokale Ausrichtung zweier Sequenzen zu berechnen.

Startwasser

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identifiziert lokale Ähnlichkeiten zwischen zwei Sequenzen mithilfe eines strengen Algorithmus, der auf der LALIGN-Anwendung basiert.

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LALIGN

LALIGN findet interne Duplikate durch Berechnung nicht schneidender lokaler Alignments von Protein- oder DNA-Sequenzen.

Starten Sie LALIGN