Alignement global

Les outils d’alignement global créent un alignement de bout en bout des séquences à aligner.

Needle (EMBOSS)

EMBOSS Needle crée un alignement global optimal de deux séquences en utilisant l’algorithme Needleman-Wunsch.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher utilise une modification de l’algorithme Needleman-Wunsch qui permet d’aligner globalement des séquences plus importantes.

Lancez Stretcher

Alignement local

Les outils d’alignement local trouvent un ou plusieurs alignements décrivant la ou les régions les plus similaires dans les séquences à aligner. Ils peuvent aligner les séquences de protéines et de nucléotides.

Water (EMBOSS)

EMBOSS Water utilise l’algorithme de Smith-Waterman (modifié pour les améliorations de vitesse) pour calculer l’alignement local de deux séquences.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identifie les similitudes locales entre deux séquences à l’aide d’un algorithme rigoureux basé sur l’application LALIGN.

Lancer Matcher

LALIGN

LALIGN trouve les duplications internes en calculant les alignements locaux non croisés de séquences de protéines ou d’ADN.

Lancez LALIGN