Global justering

Globale justeringsværktøjer skaber en ende-til-ende-tilpasning af de sekvenser, der skal justeres.

Needle (EMBOSS)

EMBOSS Needle skaber en optimal global tilpasning af to sekvenser ved hjælp af Needleman-Wunsch-algoritmen.

Launch Needle

Stretcher (EMBOSS)

EMBOSS Stretcher bruger en ændring af Needleman-Wunsch-algoritmen, der gør det muligt at justere større sekvenser globalt.

Start båre

Lokal justering

Lokale justeringsværktøjer finder en eller flere justeringer, der beskriver de mest ens region (er) inden for de sekvenser, der skal justeres. De er kan justere protein- og nukleotidsekvenser.

Vand (EMBOSS)

EMBOSS Water bruger Smith-Waterman-algoritmen (modificeret til hastighedsforbedringer) til at beregne den lokale tilpasning af to sekvenser.

Launch Water

Matcher (EMBOSS)

EMBOSS Matcher identificerer lokale ligheder mellem to sekvenser ved hjælp af en streng algoritme baseret på LALIGN-applikationen.

Launch Matcher

LALIGN

LALIGN finder interne duplikationer ved at beregne ikke-skærende lokale tilpasninger af protein eller DNA-sekvenser.

Start LALIGN