アッパーヌビアにエジプトが存在するにもかかわらず、この地域の先住民文化は繁栄し続けました。この文化は南部のアフリカの人々の影響を強く受けており、エジプトの守備隊の近さやエジプトの商人による高級品の輸入によってほとんど変化しませんでした。確かに、ヌビアのエジプト化は、ヌビア人がアジアのヒクソス侵略者に対する傭兵として多数雇用された第2中間期（紀元前1630年から1540年頃）のエジプトのヌビアに対する政治的支配の衰退の間に実際に強化されたようです。エジプト。この経験は、前世紀のエジプト軍の占領よりも、傭兵がエジプト軍で戦っている間に吸収したエジプト文化を紹介するのに役立ちました。逆に、エジプトでのこれらの傭兵の存在は、エジプト文化内でのアフリカの影響力の増大に貢献しました。

ヒクソスの敗北は、ヒクソスを追放したエジプト人の全国的な台頭の結果でした。ナイル渓谷は、ヒクソスの侵略が混乱させたヌビアの軍事占領を再確立するために、彼らのエネルギーを南に向けました。トトメス1世（紀元前1493年から1482年頃）の下で、スーダン北部のエジプトによる征服は、アブーハマドの南50マイルにあるクルクスまで完了し、その後のエジプトの軍事遠征はナイル川のさらに上まで浸透しました。この3番目のエジプトの占領は、エジプトの支配に対する散発的な反乱にもかかわらず、最も完全で最も永続的なものでした。ヌビアは、北部のワワットと、州都アスワンのクシュ（クシュとも呼ばれる）の2つの行政単位に分割されました。南は、本部がナパタ（マラウィ）にあります。ヌビアは全体として、エジプトのファラオに責任を負った副王、通常は王室の側近のメンバーによって統治されていました。彼の下には、ワワットとクシュの2人の議員と、下級官僚のヒエラルキーがいた。官僚は主にエジプト人によって配置されましたが、エジプト人のヌビア人は珍しくありませんでした。エジプトの役人、商人、司祭の植民地が行政の中心地を取り囲んでいましたが、これらの前哨基地を越えて、ヌビア人は独自の伝統、習慣、工芸品を守り続けました。このようにして、北はエジプト、南はアフリカの人々によって形作られたシンクロリズム文化がクシュで生まれました。

クシュの立場は、エジプトから紅海へ、そしてナイル川から紅海への交易路を妨害しました。南と西は、遠く離れた場所からかなりの富をもたらしました。さらに、ナイル川沿いの耕作地は豊かで、丘では金とエメラルドの鉱山がエジプトのために地金と宝石を生産しました。ヌビア人も兵士として高く評価されていました。

エジプトが新王国時代（紀元前11世紀）の終わりに再び衰退するにつれ、ヌビア軍に支えられたクシュの副王は事実上独立しました。王、エジプトの支配から解放されました。紀元前8世紀までに、クシュの王は、エジプトとの政治的関係も家族関係も持たない、エジプト化されたヌビア人の首長の遺伝的支配家族から来ました。そのような王の一人であるカシュタの下で、クッシュは上エジプト（すなわち南部）の支配権を獲得し、息子のピイ（以前はピアンキとして知られていました。紀元前750年から719年頃に統治）の下でエジプト全体を地中海沿岸に移しました。クッシュの管理下に置かれました。しかし、世界大国として、クシュは長続きしませんでした。クシュの王たちがアブー・ハマドからナイル川のデルタまで統治を確立したちょうどその時、アッシリア人はエジプトに侵攻し（紀元前671年）、優れた鉄鍛造の武器で、再建可能なタハルカの下でクシュの軍隊を打ち負かしました。 654年までに、クシテスはヌビアとその首都ナパタの安全に追いやられました。

大国から、アスワンからの南への前進を妨げる不毛の丘の背後にある孤立した王国に縮小されましたが、クッシュは続けました。ナイル川中流をさらに1000年間統治する。強力なアフリカの付加物を伴うその独特のエジプト・ヌビア文化は保存されましたが、エジプトの文化はペルシャ、ギリシャ、ローマの影響を受けました。多くの方法でエジプト化されましたが、クシュの文化はヌビアの環境における単なるエジプト文明ではありませんでした。 Kushitesは独自の言語を開発し、最初にエジプトの象形文字で表現され、次に独自の言語で表現され、最後に筆記体で表現されました。彼らはエジプトの神々を崇拝しましたが、彼ら自身を放棄しませんでした。彼らは王たちをピラミッドに葬りましたが、エジプトのやり方では葬りませんでした。彼らの富は鉱山から流れ続け、交易路の管理とともに成長し続けました。エジプトからの撤退後すぐに、首都はナパタから南のシャンディ近くのメロエに移されました。そこでは、エジプトとの関係が急速に失われていたまさにその時に、王国はますます南の老舗アフリカ文化にさらされていました。その後のクシュの歴史は徐々に衰退し、350世紀にエチオピア高原から行進し、メロエを破壊し、川沿いの老朽化した町を略奪したアクスム王による栄光の絶滅で終わりました。