Sophies syskon, särskilt hennes äldsta bror Hans, som senare blev grundare i Weiße Rose, var också medlemmar i icke-nazister grupper av ungdomar. Dessa föreningar delade och förökade en kärlek till naturen, utomhusäventyr, såväl som den tyska romantikens musik, konst och litteratur. Ursprungligen betraktades som förenliga med nazistisk ideologi av många, upplöstes dessa alternativa grupper långsamt och slutligen förbjöds 1936. Hans förblev dock aktiv i en sådan grupp och greps 1937 tillsammans med flera av Scholl-syskonen. Denna gripande satte ett prägel på Sophies samvete och inledde processen som så småningom förvandlade henne från glad anhängare av nazistsystemet till aktiv motståndskämpe.
Den 1 september 1939 invaderade Hitler Polen och två dagar senare, Frankrike och Storbritannien förklarade krig mot Tyskland. De äldre Scholl-bröderna skickades ut för att slåss på fronten. Sophies liv i Ulm förändrades också. Hon tog gymnasiet våren 1940 och började en lärlingsplats för att bli dagislärare. Hon ville så småningom studera biologi och filosofi. För att bli antagna var studenter tvungna att tillbringa en tid för staten i Reichsarbeitsdienst (RAD; National Labor Service). Sophies förhoppningar att bli lärare skulle ge henne möjlighet att ersätta RAD upphävdes och hon var istället tvungen att gå in i tjänsten våren 1941. Hon hatade det. Den militärliknande regimen och den bedövande rutinen fick henne att finna tröst i sin egen andlighet, styrd av avläsningar av teologen Augustinus av Hippo. Hon skrev ner sina tankar och noterade att hennes ”själ var hungrig” – hon längtade efter ett autonomt liv, ett slut på kriget och efter lycka med sin pojkvän Fritz Hartnagel, som nu kämpade på östfronten. Hennes tvivel om regimen växte.
När hon äntligen flyttade till München för att studera biologi och filosofi i maj 1942 hade hennes bror Hans, en medicinstudent vid samma universitet, och några av hans vänner redan börjat aktivt ifrågasätta systemet. Som tjänare vid östra fronten fick de reda på de brott som begåtts i Polen och Ryssland från första hand och såg elände med egna ögon. De visste att de inte kunde vara tysta. Från och med juni 1942 började de skriva ut och distribuera broschyrer i och runt München och kallade sina medstudenter och den tyska allmänheten till handling. Andra medlemmar i deras krets gick med i strävan och skrev fyra broschyrer fram till hösten samma år. Som student hade Sophie sett flygblad och applåderat deras innehåll såväl som författarnas mod att tala sanning till makten. När hon fick reda på sin brors engagemang krävde hon att gå med i gruppen. Hon ville inte förbli passiv längre.
Den vita rosen var en liten strävan med stora konsekvenser. Kärnan var syskonen Hans och Sophie Scholl, deras medstudenter Alexander Schmorell, Willi Graf, Christoph Probst och professor i filosofi och musikvetenskap vid universitetet i München, Kurt Huber. Tillsammans publicerade och distribuerade de sex broschyrer, först skrev de på en skrivmaskin och multiplicerades sedan med mimeograf. Först distribuerade de bara dem via post, skickade dem till professorer, bokhandlare, författare, vänner och andra – genom att gå igenom telefonböcker för adresser och skriva varje kuvert för hand. Till slut distribuerade de tusentals och nådde hushåll över hela Tyskland. Att skaffa så stora mängder papper, kuvert och stämplar i en tid av strikt ransonering utan att väcka misstankar var problematiskt, men studenterna lyckades genom att engagera ett omfattande nätverk av supportrar i städer och städer så långt norr som Hamburg och så långt söderut som Wien. Dessa nätverk aktiverades också för att distribuera broschyrerna och försökte lura Gestapo att tro att White Rose hade platser över hela landet.
När man läser gruppens broschyrer idag kan man inte låta bli att tänka på hur kyligt noggrant de var i sina anklagelser och uppmaningar till handling, och den kraftfulla insikten de ger om Nazityskland: Den tredje broschyren lyder:
