Skillnad mellan eukaryota och prokaryota promotorer
Prokaryota promotorer
I prokaryoter är promotorn består av två korta sekvenser vid -10 och -35 positioner uppströms från transkriptionsstartplatsen.
- Sekvensen vid -10 kallas Pribnow-rutan, eller -10-elementet, och består vanligtvis av de sex nukleotiderna TATAAT. Pribnow-rutan är absolut nödvändig för att starta transkription i prokaryoter.
- Den andra sekvensen vid -35 (elementet -35) består vanligtvis av de sex nukleotiderna TTGACA. Dess närvaro möjliggör en mycket hög transkriptionshastighet.
Eukaryota promotorer
Eukaryota promotorer är extremt olika och är svåra att karakterisera. De ligger vanligtvis uppströms om genen och kan ha reglerande element flera kilobaser bort från transkriptionsstartplatsen. I eukaryoter kan transkriptionskomplexet få DNA att böja sig tillbaka, vilket möjliggör placering av reglerande sekvenser långt från det faktiska transkriptionsstället. Många eukaryota promotorer innehåller en TATA-låda (sekvens TATAAA), som i sin tur binder ett TATA-bindande protein som hjälper till bildandet av RNA-polymeras transkriptionskomplex. TATA-rutan ligger vanligtvis mycket nära transkriptionsstartplatsen (ofta inom 50 baser).
