Różnica między promotorami eukariotycznymi i prokariotycznymi
Promotory prokariotyczne
W prokariotach promotor składa się z dwóch krótkich sekwencji w pozycjach -10 i -35 powyżej miejsca startu transkrypcji.
- Sekwencja w punkcie -10 nazywana jest ramką Pribnowa lub elementem -10 i zwykle składa się z sześciu nukleotydów TATAAT. Pudełko Pribnowa jest absolutnie niezbędne do rozpoczęcia transkrypcji u prokariontów.
- Druga sekwencja w pozycji -35 (element -35) zwykle składa się z sześciu nukleotydów TTGACA. Jego obecność pozwala na bardzo wysoki współczynnik transkrypcji.
Promotory eukariotyczne
Promotory eukariotyczne są niezwykle zróżnicowane i trudne do scharakteryzowania. Zwykle znajdują się przed genem i mogą mieć elementy regulatorowe kilka kilozasad od miejsca startu transkrypcji. U eukariontów kompleks transkrypcyjny może spowodować, że DNA wygina się z powrotem, co pozwala na umieszczenie sekwencji regulatorowych z dala od rzeczywistego miejsca transkrypcji. Wiele promotorów eukariotycznych zawiera kasetę TATA (sekwencja TATAAA), która z kolei wiąże białko wiążące TATA, które pomaga w tworzeniu kompleksu transkrypcyjnego polimerazy RNA. Pudełko TATA zwykle leży bardzo blisko miejsca startu transkrypcji (często w granicach 50 zasad).
