Forskel mellem eukaryote og prokaryote promotorer
prokaryote promotorer
I prokaryoter er promotoren består af to korte sekvenser ved -10 og -35 positioner opstrøms for transkriptionsstartstedet.
- Sekvensen ved -10 kaldes Pribnow-boksen eller -10-elementet og består normalt af de seks nukleotider TATAAT. Pribnow-boksen er absolut vigtig for at starte transkription i prokaryoter.
- Den anden sekvens ved -35 (elementet -35) består normalt af de seks nukleotider TTGACA. Dens tilstedeværelse tillader en meget høj transkriptionshastighed.
Eukaryote promotorer
Eukaryote promotorer er ekstremt forskellige og er vanskelige at karakterisere. De ligger typisk opstrøms for genet og kan have regulatoriske elementer flere kilobaser væk fra det transkriptionelle startsted. I eukaryoter kan transkriptionskomplekset få DNA’et til at bøje sig tilbage på sig selv, hvilket muliggør placering af regulatoriske sekvenser langt fra det faktiske transkriptionssted. Mange eukaryote promotorer indeholder en TATA-boks (sekvens TATAAA), som igen binder et TATA-bindingsprotein, som hjælper med dannelsen af RNA-polymerasetranskriptionskomplekset. TATA-boksen ligger typisk meget tæt på det transkriptionelle startsted (ofte inden for 50 baser).
