Orsakerna till felint hyperestesisyndrom är mycket omstridda, till stor del på grund av syndromets okända patofysiologi och variationen i svar på olika behandlingsmetoder. Det finns tre huvudsakliga teorier om orsaken till syndromet, som beskrivs nedan:
Den första teorin antyder att katt hyperestesisyndrom är en beteendestörning, som orsakas av antingen beteendeförskjutning eller stressfaktorer. Stress ökar frisättningen av -melanocytstimulerande hormon och orsakar ökad grooming och endorfinproduktion. Beteendeförskjutning skulle inträffa när en katt upplever en överväldigande impuls att fullborda två eller flera orelaterade beteenden samtidigt, detta kan leda till att katten fullföljer en tredje och ofta orelaterad aktivitet, till exempel grooming. Om detta förskjutningsbeteende fortsätter under en längre period kan det leda till att katten utvecklar en tvångsmässig beteendestörning som inte längre är beroende av de ursprungliga konkurrerande beteendemotivationerna. Överdriven grooming och självstympning är erkända tecken på tvångssyndrom, vilket leder till tro på den övergripande idén att syndromet är en beteendestörning, men stöder också den tredje huvudteorin som nämns senare. Det har noterats att drabbade katter tenderar att vara dominerande snarare än undergivna, vissa undersökningar hävdar att katt hyperestesisyndrom är en form av konfliktförskjutning, snarare än bara en form av allmän beteendeförflyttning, där den drabbade katten agerar ut motverkade territoriella tvister om dess egen kropp. Den övergripande teorin om att felint hyperestesisyndrom är en beteendestörning ifrågasätts på grundval av variationen i respons hos drabbade katter på beteendemodifiering och psykoaktiva läkemedel, eftersom ett rent beteendessyndrom kan förväntas komma in i remission efter tillämpningen av ovannämnda terapeutiska behandlingar .
Den andra teorin föreslår att syndromet är en anfallsstörning, och att episoder av vokalisering, vild löpning, hoppning, okontrollerad urinering och svansjakt är fall av epileptisk aktivitet. Denna teori stöds av rapporter om katter som visar tecken på epileptiska anfall efter en attack, med utvidgade pupiller och förvirrad och frånvarande beteende. Användning av antiepileptika uppnår ett partiellt svar hos vissa drabbade katter, men drabbade katter litar vanligtvis på en blandning av terapeutiska behandlingar för att bekämpa alla kliniska tecken. Denna teori är ifrågasatt på grund av att det finns varierande svar hos drabbade katter på de antiepileptiska läkemedlen som används för behandling och brist på känd neurologisk orsak utan att några bevis har visat sig visa intrakraniella eller extrakraniella orsaker till epilepsi.
Den slutliga teorin, av de tre huvudteorierna, är att syndromet inte är en distinkt enhet utan ett konglomerat av unikt beteende orsakat av en mängd olika miljö- och beteendefaktorer. Denna teori stöds av variationen i kliniska tecken hos drabbade katter, där många av de kliniska tecknen finns inom andra kattstörningar inklusive dermatologiska, beteendemässiga, ortopediska och neurologiska störningar. Ytterligare stöd för denna teori tillhandahålls av det blandade svaret på ett brett spektrum av terapeutisk behandling. Sammantaget har emellertid enighet om teorins giltighet ännu inte uppnåtts.
För närvarande är det okänt om det finns någon genetisk koppling till sjukdomen. Även om kattens ålder, ras eller kön kan utveckla katt hyperestesisyndrom, har det noterats att abessinska, burmesiska, Himalaya och siamesiska raser verkar ha en ökad risk att utveckla sjukdomen, därför finns det en möjlighet till en genetisk koppling.
Det har också observerats att skada kan vara en predisponerande faktor för felint hyperestesisyndrom. Men eftersom skador drabbar katter på många sätt; ökar deras stress och ångest samt påverkar deras fysiska välbefinnande, avgör inte denna kunskap debatten om huruvida tillståndet är beteendemässigt, epileptiskt eller ett paraplybegrepp för flera underliggande tillstånd.
När det gäller tidiga teorier, vissa anser att stympning är associerad med neuropatisk smärta snarare än ett direkt kliniskt tecken på felint hyperestesisyndrom. Detta skulle vara fallet om felint hyperestesisyndrom orsakar allodyni, en smärtsam reaktion på stimuli som annars inte skulle orsaka smärta, eller alloknes, där stimuli orsakar en pruriceptiv känsla, allmänt känd som klåda, där stimuli annars inte skulle göra det. Det är anmärkningsvärt när man överväger denna teori att vissa katter har varit kända för att slicka svansens botten snarare än att klia eller bita, vilket kan tyda på att de inte känner smärta eller klåda utan snarare en överväldigande tvångsmotivation.Det har dock antagits att på grund av klåda och smärtreceptorer som delar perifera och centrala nervsystemets vägar, kan den underliggande smärtan resultera i den överdrivna grooming som beskrivs. Oavsett om en drabbad katt uppvisar grooming eller självstympande beteenden, tenderar de alla att springa frenetiskt efter avslutad aktivitet.