Erin Bruner, ambitna prawniczka pragnąca zostać starszym wspólnikiem w swojej kancelarii, zajmuje się sprawą księdza Richarda Moore’a, katolickiego księdza diecezjalnego oskarżonego o zaniedbanie morderstwa w następstwie próba egzorcyzmu 19-letniej uczennicy Emily Rose. Podczas gdy archidiecezja chce, aby Moore przyznał się do winy w celu zminimalizowania publicznej uwagi przestępstwa, Moore zamiast tego przyznaje się do niewiny. Podczas procesu zeznania świadków są wizualizowane za pomocą retrospekcji. Prokurator Ethan Thomas przesłuchuje kilku lekarzy i neurologów, aby ustalić przyczynę medyczną śmierci Emily, zwłaszcza epilepsji i schizofrenii. Emily zrezygnowała ze studiów po tym, jak o trzeciej nad ranem regularnie cierpiała na urojenia i skurcze mięśni. Wróciła do domu swoich rodziców i była leczona lekami na padaczkę i psychozę. Gdy jej stan się nie poprawiał, skonsultowano się z Moore’em. jego ocena i obserwacje doprowadziły go do wniosku, że Emily była opętana przez demona. Za zgodą rodziców Emily, Moore poddał Emily egzorcyzmowi, który ostatecznie się nie powiódł. Moore przypuszczał, że lekarstwa Emily były winne nieudanego wydalenia, ponieważ sparaliżowały aktywność mózgu Emily i trzymały demona poza zasięgiem.

Moore, chcąc opowiedzieć historię Emily, daje zeznania, kiedy zostaje wezwany na stanowisko świadka. Bruner zaczyna doświadczać w domu zjawisk nadprzyrodzonych, budząc się o 3 nad ranem na zapach spalonego materiału. Moore ostrzega ją, że może być celem dla demonów, ujawniając, że on również doświadczył podobnych zjawiska tej nocy, kiedy przygotowywał egzorcyzmy. Bruner wspiera Moore’a, wzywając antropolog Sadirę Adani do złożenia zeznań na temat wierzeń dotyczących duchowego opętania z różnych kultur, ale Thomas odrzuca jej twierdzenia jako bzdury. Graham Cartwright, lekarz, który uczestniczył w egzorcyzmach, podaje Bruner kasetę, na której nagrano egzorcyzmy, a Moore przedstawia to nagranie jako dowód. Zeznania Cartwrighta potwierdzające egzorcyzmy i obalające sprawę medyczną prokuratury zostały powstrzymane d, gdy nagle zostaje potrącony przez samochód. Zrozpaczony Bruner wycofuje się do swojego biura, gdzie jej szef grozi jej zwolnieniem, jeśli pozwoli Moore’owi ponownie zeznawać. Bruner odwiedza Moore’a w jego celi więziennej, gdzie przekonuje ją, by pozwoliła mu opowiedzieć resztę historii Emily pomimo groźby jej szefa.

Następnego dnia Moore ponownie staje świadkiem i czyta list, który Emily napisała przed śmiercią. Następnego ranka po egzorcyzmach Maryja odwiedziła Emily na polu w pobliżu jej domu i otrzymała pozwolenie na wstąpienie do nieba. Jednak Emily postanowiła znieść swoje cierpienie i później otrzymała stygmaty na rękach. Tomasz nie interpretuje tych oznaczeń jako boskiego znaku, ale raczej jako ślady samookaleczeń. Ostatecznie ława przysięgłych wydaje wyrok winy, ale zaskakuje sąd, prosząc sędziego Brewstera o orzeczenie kary pozbawienia wolności. Chociaż chwilowo zszokowany sugestią, Brewster ostatecznie ją przyjmuje i Moore może odejść. Brunerowi zaproponowano partnerstwo w jej firmie, ale odmawia. Później Moore i Bruner składają wizytę w grobie Emily, a Moore stwierdza, że nadejdzie czas, w którym Emily zostanie ogłoszona świętą.