Forskjell mellom eukaryote og prokaryote promotorer
Prokaryote promotorer
I prokaryoter er promoteren består av to korte sekvenser ved -10 og -35 posisjoner oppstrøms fra transkripsjonsstartstedet.
- Sekvensen ved -10 kalles Pribnow-boksen, eller -10-elementet, og består vanligvis av de seks nukleotidene TATAAT. Pribnow-boksen er helt essensiell for å starte transkripsjon i prokaryoter.
- Den andre sekvensen ved -35 (-35-elementet) består vanligvis av de seks nukleotidene TTGACA. Dens tilstedeværelse tillater en veldig høy transkripsjonshastighet.
Eukaryote promotorer
Eukaryotic promoters er ekstremt forskjellige og er vanskelige å karakterisere. De ligger vanligvis oppstrøms for genet og kan ha regulatoriske elementer flere kilobaser unna transkripsjonsstartstedet. I eukaryoter kan transkripsjonskomplekset føre til at DNA bøyes tilbake på seg selv, noe som muliggjør plassering av regulatoriske sekvenser langt fra selve transkripsjonsstedet. Mange eukaryote promotere inneholder en TATA-boks (sekvens TATAAA), som igjen binder et TATA-bindende protein som hjelper til med dannelsen av RNA-polymerase transkripsjonskompleks. TATA-boksen ligger vanligvis veldig nær transkripsjonsstartstedet (ofte innen 50 baser).
