Kapalua lufthavn styres av en spesiell avtale inngått av staten med Maui County. En tidligere, privateid flyplass, store endringer eller forbedringer av Kapalua lufthavn kan ikke gjøres uten samtykke fra Maui County Council. Fylket insisterer på å begrense utviklingen for å bevare Kapalua-samfunnet fra kommersialisering. Kapalua lufthavn er begrenset til en enkelt rullebane, et par terminalfasiliteter og støttefasiliteter. Det er ingen luftfraktanlegg. Driften er begrenset til dagtid. Passasjerer som går med «Ohana Airlines vil gå gjennom TSA-screening. Passasjerer som avgår på Mokulele Airlines blir ikke screenet av TSA.
United States Department of Agriculture opprettholder en inspeksjonsstasjon fra kl. 07.30 til 13.45. Passasjerer som har endelig destinasjon til USAs fastland, må få kontrollert og merket sine innsjekede poser hvis de sjekker sekkene sine til deres endelige amerikanske fastlandsdestinasjon. Passasjerer som forlater Kapalua lufthavn på flyreiser som avgår etter kl. 13:45, vil ikke kunne sjekke bagasjen. til amerikanske destinasjoner på fastlandet og må hente sine innsjekkede bagasjer ved bagasjekrav i Honolulu, få dem inspisert av Honolulu USDA, sjekke inn på billettdisken til Honolulu Airport-flyselskapet og passere TSA-sikkerhet i Honolulu for å fortsette til endelige destinasjon for det amerikanske fastlandet. Landbruksinspeksjon er bare nødvendig for poser med avgang fra Hawaii til USAs fastland.
Det er en snackbar som tilbyr et utvalg av lette snacks, måltider og drikkevarer.
Flyplassen dekker en areal på 20 dekar (20 ha) i en høyde på 256 fot (78 m) over gjennomsnittlig havnivå. Den har en rullebane betegnet 2/20 med en asfaltflate som måler 3000 x 100 fot (914 x 30 m). For tolvmånedersperioden som endte 31. desember 2004, hadde flyplassen 9 990 flyoperasjoner, et gjennomsnitt på 27 per dag: 51% planlagt kommersiell og 49% lufttaxi.