Après les funérailles de sa mère, tuée à Berlin par un bombardement allié, Ralf dit à Bruno et Gretel qu’Elsa leur suggère de vivre avec un parent où il est plus sûr; en vérité, la mère ne veut pas que ses enfants vivent avec leur père meurtrier. Le père de Shmuel a disparu après avoir participé à une marche, et Bruno décide de se racheter en aidant Shmuel à retrouver son père. Enfilant une tenue rayée de prisonnier et une casquette pour couvrir sa tête mal rasée, Bruno creuse sous la clôture pour rejoindre Shmuel. Il est choqué de voir les nombreux Juifs malades et à l’air faible, et les garçons sont emmenés en marche avec d’autres détenus par Sonderkommandos.
À la maison, Gretel et Elsa découvrent la disparition de Bruno et Elsa fait irruption dans la réunion de Ralf pour l’avertir que Bruno est porté disparu. Ralf et ses hommes lancent une recherche, suivis par Elsa et Gretel. Un chien suit l’odeur de Bruno jusqu’à ses vêtements jetés à l’extérieur de la clôture, et Ralf entre dans le camp. Bruno, Shmuel et les détenus sont emmenés dans un vestiaire et on leur dit de retirer leurs vêtements pour une «douche». Ils sont tous emballés. dans une chambre à gaz alors que les lumières s’éteignent, Bruno et Shmuel se tenant la main se réconfortant tandis qu’un soldat de Schutzstaffel verse des pastilles de Zyklon B à l’intérieur de la chambre, et les prisonniers commencent à paniquer de peur. crie le nom de son fils; à la clôture, Elsa et Gretel entendent les cris de Ralf et tombent à genoux de désespoir. Le film se termine par montrer la porte fermée de la chambre à gaz maintenant silencieuse, indiquant que tous les prisonniers, y compris Bruno et Shmuel, sont morts.