Rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory
prokaryotickými promotory
U prokaryot je promotor sestává ze dvou krátkých sekvencí v polohách -10 a -35 proti proudu od místa zahájení transkripce.
- Sekvence v -10 se nazývá Pribnowovo pole nebo -10 prvek a obvykle se skládá ze šesti nukleotidů TATAAT. Políčko Pribnow je naprosto nezbytné pro zahájení transkripce u prokaryot.
- Druhá sekvence na -35 (prvek -35) se obvykle skládá ze šesti nukleotidů TTGACA. Jeho přítomnost umožňuje velmi vysokou transkripční rychlost.
Eukaryotické promotory
Eukaryotické promotory jsou extrémně rozmanité a je obtížné je charakterizovat. Obvykle leží před genem a mohou mít regulační prvky vzdálené několik kilobází od počátečního místa transkripce. U eukaryot může transkripční komplex způsobit, že se DNA ohne zpět na sebe, což umožňuje umístění regulačních sekvencí daleko od skutečného místa transkripce. Mnoho eukaryotických promotorů obsahuje TATA box (sekvence TATAAA), který se zase váže na TATA vázající protein, který pomáhá při tvorbě transkripčního komplexu RNA polymerázy. Pole TATA obvykle leží velmi blízko startovacího místa transkripce (často do 50 bází).