Před zřízením hlavního města zákonodárné shromáždění využívalo budovu provinční delegace, v níž nyní sídlí ministerstvo zahraničí. Myšlenka na vybudování hlavního města byla poprvé představena bývalým komisařem rezidentem Luisem Muñozem Riverou v roce 1907 a měla částečně demonstrovat určitý stupeň civilní vlády na ostrově, který byl v té době kolonií Spojených států. Projekt, který navrhl Muñoz Rivera, přidělil na stavbu 3 miliony dolarů a stanovil pravidla pro soutěž mezi architekturami, která má rozhodnout, která z nich tuto práci provede.

V září 1907 zaslal komisař vnitra Laurence Grahame oficiální žádost pro architekty prostřednictvím tisku a časopisů Spojených států. Specifikace budovy spočívala v tom, že měla mít tři hlavní instalace: Výkonnou radu, Sněmovnu delegátů a Nejvyšší soud. Mělo to být jednoduché, konzervativní a přiměřené povětrnostním podmínkám ostrova. Bylo předloženo 134 architektonických návrhů z USA, Kuby, Kanady, Francie, Španělska a Portorika.

Hodnocení návrhy měl na starosti William F. Willoughby (předseda výkonné rady), José de Diego (předseda sněmovny, zastoupený Luisem Muñozem Riverou), José S. Quiñones (předseda Nejvyššího soudu) a Laurence Grahame. Do komise byli požádáni také tři američtí architekti: EB Homerde, John E. Howe a Bowen Bancroft Smith. Nakonec byly vybrány tři projekty, které patřily Frankovi E. Perkinsovi (New York City), James H. Ritchie a Lewis B. Abbot (Boston) a Henry L. Beadle (New York).

Nakonec byl vybrán projekt od Franka E. Perkinse, který představil neoklasicistní styl s malou výzdobou. Hlavní sály byly uspořádány kolem centrální terasa s jižní fasádou vedoucí do haly. Ve vstupní hale byla kopule nahoře, která nesla styl podobný Pantheonu v Římě, včetně oculus. Napravo by byl zasedací sál pro výkonnou radu a nalevo pro Sněmovnu delegátů. Nejvyšší soud se schází v hale obrácené na sever.

Luis Muñoz Rivera a místní tisk však upřednostňovaly jiný projekt, který byl hodnotící komisí diskvalifikován, protože architekt do plánů zahrnul slogan, který byl zakázán. Projekt patřil portorikánskému inženýrovi Carlos del Valle Zeno. Del Valleův projekt představil renesanční styl s neoklasickými objednávkami.

Navzdory veřejnému mínění byl Perkins najat, aby vytvořil stavební plány pro Capitol, které byly poté vydraženy. Do roku 1920 to nebylo projekt byl znovu zahájen, když komisař vnitra Guillermo Esteves zveřejnil nový design. Ke změně došlo po revizi ministerstva vnitra, která shledala Perkinsův „design nevhodným. S dohledem architektů Adriana C. Finlaysona, Franciska Roldána a Pedra de Castra byly nové plány vytvořeny v renesančním stylu.

Stavba budovy nakonec začala v roce 1921 pod vedením Antonia R. Barceló. Stavba však byla zastavena po dokončení první úrovně. Když Finlayson onemocněl, byl nahrazen Rafaelem Carmoegou, který spolu s architekty Joseph O „Kelly, William Schimmelpfennig, Harry Pembleton, Albert Nichols, Luis F. Pina a Gonzalo Fernós Maldonado vytvořili další design pro dokončení struktury.

Jejich design zahrnoval některé prvky z Perkinsova původní design, včetně kopule. Modelem pro centrální konstrukci a kopuli byl model Low Memorial Library na Kolumbijské univerzitě.

Budova byla slavnostně otevřena 11. února 1929 při prvním setkání Legislativa Shromáždění proběhlo o tři dny později.

V americkém národním registru historických míst bylo zapsáno v roce 1977 jako El Capitolio de Puerto Rico.