Unterschied zwischen eukaryotischen und prokaryotischen Promotoren
Prokaryontische Promotoren
In Prokaryoten der Promotor besteht aus zwei kurzen Sequenzen an -10 und -35 Positionen stromaufwärts von der Transkriptionsstartstelle.
- Die Sequenz bei -10 wird als Pribnow-Box oder -10-Element bezeichnet und besteht normalerweise aus den sechs Nukleotiden TATAAT. Die Pribnow-Box ist unbedingt erforderlich, um die Transkription in Prokaryoten zu starten.
- Die andere Sequenz bei -35 (das -35-Element) besteht normalerweise aus den sechs Nukleotiden TTGACA. Seine Anwesenheit ermöglicht eine sehr hohe Transkriptionsrate.
Eukaryontische Promotoren
Eukaryontische Promotoren sind äußerst vielfältig und schwer zu charakterisieren. Sie liegen typischerweise stromaufwärts des Gens und können regulatorische Elemente aufweisen, die mehrere Kilobasen von der Transkriptionsstartstelle entfernt sind. Bei Eukaryoten kann der Transkriptionskomplex dazu führen, dass sich die DNA auf sich selbst zurückbiegt, was die Platzierung von regulatorischen Sequenzen fernab der tatsächlichen Transkriptionsstelle ermöglicht. Viele eukaryotische Promotoren enthalten eine TATA-Box (Sequenz TATAAA), die wiederum ein TATA-Bindungsprotein bindet, das die Bildung des RNA-Polymerase-Transkriptionskomplexes unterstützt. Die TATA-Box liegt typischerweise sehr nahe an der Transkriptionsstartstelle (oft innerhalb von 50 Basen).