Verschil tussen eukaryote en prokaryote promotors
Prokaryote promotors
In prokaryoten, de promotor bestaat uit twee korte sequenties op de posities -10 en -35 stroomopwaarts van de startplaats van de transcriptie.
- De reeks op -10 wordt de Pribnow-box of het -10-element genoemd en bestaat gewoonlijk uit de zes nucleotiden TATAAT. De Pribnow-box is absoluut essentieel om de transcriptie in prokaryoten te starten.
- De andere sequentie op -35 (het -35 element) bestaat gewoonlijk uit de zes nucleotiden TTGACA. Zijn aanwezigheid maakt een zeer hoge transcriptiesnelheid mogelijk.
Eukaryote promotors
Eukaryote promotors zijn buitengewoon divers en moeilijk te karakteriseren. Ze liggen typisch stroomopwaarts van het gen en kunnen regulerende elementen hebben op enkele kilobasen verwijderd van de transcriptionele startplaats. Bij eukaryoten kan het transcriptiecomplex ervoor zorgen dat het DNA naar zichzelf terugbuigt, waardoor regulerende sequenties ver van de werkelijke plaats van transcriptie kunnen worden geplaatst. Veel eukaryote promoters bevatten een TATA-box (sequentie TATAAA), die op zijn beurt een TATA-bindend eiwit bindt dat helpt bij de vorming van het transcriptiecomplex van RNA-polymerase. De TATA-box ligt meestal heel dicht bij de transcriptiestartsite (vaak binnen 50 bases).
