Det er en utbredt oppfatning at å spise lokal, ubearbeidet eller «rå» honning kan hjelpe allergisymptomer ved regelmessig å utsette deg for pollen – ikke ulikt konseptet med hvordan allergisk skudd fungerer. Allergiinjeksjoner hjelper med å desensibilisere pollenallergiske mennesker ved å utsette dem for en bestemt pollen- eller pollenblanding injisert med jevne mellomrom. En viktig forskjell her er at pollenmengdene i allergiinjeksjoner er kjent, og gradvis øker til et visst nivå, for best resultat. Studier har vist at allergisk skudd er svært effektive for å redusere sesongmessige allergisymptomer. Lokal, ubehandlet honning inneholder små mengder pollen fra miljøet. Pollen i honning kommer hovedsakelig fra blomstene der bier finnes (med blomstrende plantepollen som er mindre sannsynlig å forårsake allergisymptomer) og allergifremkallende, luftbåren pollen fra trær, gress og ugress (ikke pollinert av bier!) I mindre mengder. Mengden av allergifremkalt pollen i honningen er vanligvis veldig liten, da bier ikke med vilje innlemmer dette pollenet i honningen. Dette regnes som en forurensning, som bieelementene, muggsporer, bakterier og andre miljøpartikler som kan være funnet i honning. (Kommersiell prosessering ser ut til å fjerne mest pollen og forurensninger.) Det er ikke noe vitenskapelig bevis for at å spise lokal honning vil forbedre sesongmessige allergier. En studie, publisert i 2002 i Annals of Allergy, Asthma & Immunologi, viste ingen forskjell blant allergikere som spiste lokal honning, kommersielt bearbeidet honning eller en honning-smaksatt placebo. Og i sjeldne tilfeller kan det faktisk være en risiko. Hos ekstremt følsomme individer, inntak av ubehandlet honning kan føre til en øyeblikkelig allergisk reaksjon som involverer munn, svelg eller hud – som kløe, elveblest eller hevelse – eller til og med anafylaksi. Slike reaksjoner kan være relatert til forurensninger fra pollen eller bie.