Differenza tra promotori eucarioti e procarioti
Promotori procarioti
Nei procarioti, il promotore consiste di due brevi sequenze a -10 e -35 posizioni a monte del sito di inizio della trascrizione.
- La sequenza a -10 è chiamata scatola di Pribnow, o elemento -10, e di solito è costituita dai sei nucleotidi TATAAT. La scatola Pribnow è assolutamente essenziale per iniziare la trascrizione nei procarioti.
- L’altra sequenza a -35 (l’elemento -35) di solito è costituita dai sei nucleotidi TTGACA. La sua presenza consente un tasso di trascrizione molto elevato.
Promotori eucariotici
I promotori eucarioti sono estremamente diversi e difficili da caratterizzare. In genere si trovano a monte del gene e possono avere elementi regolatori a diversi kilobasi di distanza dal sito di inizio trascrizionale. Negli eucarioti, il complesso trascrizionale può far piegare il DNA su se stesso, il che consente il posizionamento di sequenze regolatorie lontano dal sito effettivo di trascrizione. Molti promotori eucariotici contengono una scatola TATA (sequenza TATAAA), che a sua volta lega una proteina legante TATA che aiuta nella formazione del complesso trascrizionale della RNA polimerasi. La casella TATA si trova in genere molto vicino al sito di inizio della trascrizione (spesso entro 50 basi).
