Erin Bruner, un ambizioso avvocato che cerca di diventare un socio senior nel suo studio legale, prende il caso di padre Richard Moore, un prete diocesano cattolico accusato di omicidio colposo a seguito di un ha tentato l’esorcismo della studentessa 19enne Emily Rose. Mentre l’arcidiocesi vuole che Moore si dichiari colpevole per ridurre al minimo l’attenzione pubblica del crimine, Moore invece si dichiara non colpevole. Durante il processo, le dichiarazioni dei testimoni vengono visualizzate tramite flashback. Il procuratore Ethan Thomas interroga diversi medici e neurologi per stabilire una causa medica per la morte di Emily, in particolare per l’epilessia e la schizofrenia. Emily aveva abbandonato i suoi studi universitari dopo essere stata costantemente colpita da deliri e spasmi muscolari alle 3:00 del mattino. È tornata a casa dei suoi genitori ed è stata curata con farmaci per l’epilessia e la psicosi. Moore è stata consultata quando le sue condizioni non sono migliorate e la sua valutazione e le sue osservazioni lo portarono alla conclusione che Emily fosse posseduta da un demone. Con il consenso dei genitori di Emily, Moore sottopose Emily a un esorcismo che alla fine fallì. Moore ha ipotizzato che i farmaci di Emily fossero la causa della mancata espulsione, poiché paralizzavano l’attività cerebrale di Emily e tenevano il demone fuori portata.
Moore, volendo raccontare la storia di Emily, racconta la sua testimonianza quando viene chiamato al banco dei testimoni. Bruner inizia a sperimentare fenomeni soprannaturali a casa, svegliandosi alle 3:00 con l’odore di materiale in fiamme. Moore la avverte che potrebbe essere un bersaglio per i demoni, rivelando che anche lui ha sperimentato simili fenomeni nella notte in cui stava preparando l’esorcismo. Bruner sostiene Moore convocando l’antropologa Sadira Adani per testimoniare sulle credenze che circondano il possesso spirituale di varie culture, ma Thomas respinge le sue affermazioni come assurdità. Bruner una cassetta sulla quale è stato registrato l’esorcismo, e Moore presenta la registrazione come prova. La testimonianza di Cartwright per autenticare l’esorcismo e confutare il caso medico dell’accusa è prevente d quando viene investito improvvisamente da un’auto. Bruner, sconvolta, si ritira nel suo ufficio, dove il suo capo la minaccia di licenziare se permette a Moore di testimoniare di nuovo. Bruner visita Moore nella sua cella di prigione, dove la convince a permettergli di raccontare il resto della storia di Emily nonostante la minaccia del suo capo.
Il giorno dopo, Moore torna al banco dei testimoni e legge una lettera che Emily ha scritto prima di morire. La mattina dopo l’esorcismo, Emily è stata visitata dalla Vergine Maria in un campo vicino a casa sua e le è stata concessa la scelta di ascendere al Cielo. Tuttavia, Emily ha scelto di sopportare la sua sofferenza e in seguito ha ricevuto le stimmate sulle mani. Tommaso non interpreta i segni come un segno divino, ma piuttosto come tracce di ferite autoinflitte. La giuria alla fine raggiunge un verdetto di colpevolezza, ma sorprende la corte chiedendo al giudice Brewster di emettere una condanna a tempo scontato. Anche se momentaneamente scioccato dal suggerimento, Brewster alla fine lo accetta e Moore è libero di andarsene. A Bruner viene offerta una partnership nella sua azienda, ma rifiuta. Più tardi, Moore e Bruner fanno visita alla tomba di Emily e Moore afferma che verrà il tempo in cui Emily sarà dichiarata santa.