A migrénes betegek érzékeny idegrendszere lehetővé teheti számukra, hogy bizonyos specifikus szagok vagy megvilágítás által kiváltott támadásokat érjenek el helyzetek. Ha valódi allergia áll fenn a levegőben lévő vegyületekre, az orr- vagy a légzőszövetek az allergiában szerepet játszó fehérvérsejtek vagy gyulladás miatt reagálnak. Ez olyan vegyi anyagok felszabadulását eredményezi, amelyek orrduguláshoz, vízelvezetéshez és tüsszögéshez vezetnek, amelyek jellemzően a szénanáthával függenek össze. Az immunrendszer és a fertőzésért felelős fehérvérsejtek egy része nem talált bizonyítékot az allergia és a migrén kapcsolatára. A migrénben szenvedőknek azonban nagyobb a kockázata annak, hogy allergiában és asztmában szenvedjenek. Az egyik gyakori tényező a gyulladás szerepe ezekben a rendellenességekben.

Vannak olyan személyek, akiknek légzőszervi vagy szezonális allergiája van, ami hozzájárul vagy orrüregéből eredő fejfájást okoz. passzusok vagy orrmelléküregek. A vizsgálatok és a diagnosztikai tesztek elkülöníthetik és kifejezetten segíthetnek a problémák megoldásában a legtöbb beteg számára.

Időnként a migrénes és más fejfájásos betegek allergiás problémákkal járó fejfájást kaphatnak. Az allergiás reakció megnövelheti normális fejfájásuk vagy migrénjük növekedését. Ezeket a fejfájásokat nem szabad összetéveszteni a “sinus fejfájással” vagy a “sinus fertőzéssel”, hanem migrénként kell diagnosztizálni és kezelni.