Antes del establecimiento del Capitolio, la Asamblea Legislativa utilizaba el Edificio de la Delegación Provincial, que ahora alberga el Departamento de Estado. La idea de construir un capitolio fue introducida por primera vez por el ex comisionado residente Luis Muñoz Rivera en 1907, y en parte tenía la intención de demostrar cierto grado de gobierno civil en la isla, que en ese momento era una colonia de los Estados Unidos. El proyecto propuesto por Muñoz Rivera asignó $ 3 millones para la construcción y estableció las bases para un concurso entre arquitecturas para decidir cuál haría la obra.

En septiembre de 1907, el comisionado del Interior Laurence Grahame envió la solicitud oficial para arquitectos a través de la prensa y revistas de Estados Unidos. Las especificaciones del edificio eran que se suponía que tendría tres instalaciones principales: el Consejo Ejecutivo, la Cámara de Delegados y la Corte Suprema. Se suponía que era simple, conservador y apropiado a las condiciones climáticas de la isla. Se enviaron 134 diseños arquitectónicos de Estados Unidos, Cuba, Canadá, Francia, España y Puerto Rico.

La evaluación de las propuestas estuvieron a cargo de William F. Willoughby (presidente del Consejo Ejecutivo), José de Diego (presidente de la Cámara, representado por Luis Muñoz Rivera), José S. Quiñones (presidente de la Corte Suprema) y Laurence Grahame. También se pidió la incorporación de tres arquitectos estadounidenses: EB Homerde, John E. Howe y Bowen Bancroft Smith. Al final, se seleccionaron tres proyectos, pertenecientes a Frank E. Perkins (Nueva York), James H. Ritchie y Lewis B. Abbot (Boston) y Henry L. Beadle (Nueva York).

Finalmente, el proyecto elegido fue el de Frank E. Perkins, que presentaba un estilo neoclásico con poca ornamentación. Los salones principales se organizaban en torno a una Patio central, con la fachada sur que da al lobby. El vestíbulo tenía la cúpula de arriba, que tenía un estilo similar al Panteón de Roma, incluido el óculo. A la derecha, habría una sala de sesiones para el Consejo Ejecutivo y a la izquierda para la Cámara de Delegados. La Corte Suprema se reuniría en una sala orientada al norte.

Sin embargo, Luis Muñoz Rivera y la prensa local prefirieron otro proyecto que fue descalificado por el comité evaluador, porque el arquitecto había incluido un eslogan en los planos, que estaba prohibido. El proyecto pertenecía a un ingeniero puertorriqueño llamado Carlos del Valle Zeno. El proyecto de Del Valle presentaba un estilo renacentista, con órdenes neoclásicas.

A pesar de la opinión pública, Perkins fue contratado para realizar los planos de construcción del Capitolio, que luego fueron subastados. No fue hasta 1920 cuando el El proyecto se retomó cuando el Comisionado de Gobernación, Guillermo Esteves, publicó un nuevo diseño. El cambio se produjo después de una revisión del Departamento de Interior, que consideró inadecuado el diseño de Perkins. Con la supervisión de los arquitectos Adrian C. Finlayson, Francisco Roldán y Pedro de Castro, se realizaron nuevos planos de estilo renacentista.

La construcción del edificio finalmente comenzó en 1921 bajo el liderazgo de Antonio R. Barceló, sin embargo, la construcción se detuvo una vez finalizado el primer nivel. Cuando Finlayson se enfermó, fue reemplazado por Rafael Carmoega quien, junto con los arquitectos Joseph O «Kelly, William Schimmelpfennig, Harry Pembleton, Albert Nichols, Luis F. Pina y Gonzalo Fernós Maldonado, hicieron otro diseño para terminar la estructura.

Su diseño incorporó algunos de los elementos de Perkins. diseño original, incluida la cúpula. El modelo de la estructura central y la cúpula fue el de la Biblioteca Low Memorial de la Universidad de Columbia.

El edificio se inauguró el 11 de febrero de 1929, con la primera reunión de la Legislat ive Asamblea que tendrá lugar tres días después.

Fue incluido en el Registro Nacional de Lugares Históricos de EE. UU. en 1977 como El Capitolio de Puerto Rico.