Der Flughafen Kapalua unterliegt einer besonderen Vereinbarung des Staates mit dem Landkreis Maui. Ein ehemaliger Flughafen in Privatbesitz, größere Änderungen oder Verbesserungen am Flughafen Kapalua können nicht ohne die Zustimmung des Maui County Council vorgenommen werden. Der Landkreis besteht darauf, die Entwicklung einzuschränken, um die Kapalua-Gemeinde vor der Kommerzialisierung zu bewahren. Der Flughafen Kapalua ist auf eine einzige Landebahn, einige Terminaleinrichtungen und Unterstützungseinrichtungen beschränkt. Es gibt keine Luftfrachtanlagen. Der Betrieb ist nur auf die Tagesstunden beschränkt. Passagiere, die mit „Ohana Airlines“ abfliegen, durchlaufen die TSA-Überprüfung. Passagiere, die mit Mokulele Airlines abfliegen, werden nicht von TSA überprüft.
Das US-Landwirtschaftsministerium unterhält von 7:30 bis 13:45 Uhr eine Inspektionsstation Passagiere, deren endgültiges Ziel das US-amerikanische Festland ist, müssen ihr aufgegebenes Gepäck überprüfen und kennzeichnen lassen, wenn sie ihr Gepäck bis zu ihrem endgültigen Ziel auf dem US-amerikanischen Festland einchecken. Passagiere, die den Flughafen Kapalua auf Flügen verlassen, die nach 13:45 Uhr abfliegen, können ihr Gepäck nicht mehr überprüfen bis zu Zielen auf dem US-amerikanischen Festland und müssen ihr aufgegebenes Gepäck bei der Gepäckausgabe in Honolulu abholen, von Honolulu USDA inspizieren lassen, am Ticketschalter ihrer Fluggesellschaft am Flughafen Honolulu einchecken und die TSA-Sicherheit in Honolulu passieren, um weiter zu ihrem Gepäck zu gelangen endgültiges Ziel auf dem US-amerikanischen Festland. Eine landwirtschaftliche Inspektion ist nur für Taschen erforderlich, die Hawaii auf dem Weg zum US-amerikanischen Festland verlassen.
Es gibt eine Snackbar, die eine Auswahl an leichten Snacks, Mahlzeiten und Getränken anbietet.
Der Flughafen umfasst eine Fläche von 20 ha auf einer Höhe von 78 m über dem mittleren Meeresspiegel. Es hat eine Landebahn mit der Bezeichnung 2/20 mit einer Asphaltoberfläche von 914 x 30 m (3.000 x 100 Fuß). In dem am 31. Dezember 2004 endenden Zwölfmonatszeitraum hatte der Flughafen 9.990 Flugbetriebe, durchschnittlich 27 pro Tag: 51% planmäßige kommerzielle und 49% Lufttaxis.
