Alinierea de secvențe în perechi
Alinierea globală
Instrumentele de aliniere globală creează o aliniere cap la cap a secvențelor care urmează să fie aliniate.
Needle (EMBOSS)
EMBOSS Needle creează o aliniere globală optimă a două secvențe utilizând algoritmul Needleman-Wunsch.
Launch Needle
Stretcher (EMBOSS)
EMBOSS Stretcher folosește o modificare a algoritmului Needleman-Wunsch care permite alinierea secvențelor mai mari la nivel global.
Launch Stretcher
Alinierea locală
Instrumentele de aliniere locală găsesc una sau mai multe alinieri