Antes do estabelecimento do Capitólio, a Assembleia Legislativa usava o Edifício da Delegação Provincial, que agora abriga o Departamento de Estado. A ideia de construir um capitólio foi introduzida pela primeira vez pelo ex-comissário residente Luis Muñoz Rivera em 1907, e foi em parte destinada a demonstrar algum grau de governo civil na ilha, que na época era uma colônia dos Estados Unidos. O projeto proposto por Muñoz Rivera destinou US $ 3 milhões para a construção e estabeleceu regras para um concurso entre arquiteturas para decidir qual faria a obra.

Em setembro de 1907, o comissário do Interior Laurence Grahame enviou o pedido oficial para arquitetos por meio da imprensa e revistas dos Estados Unidos. As especificações do prédio eram de que deveria ter três instalações principais: o Conselho Executivo, a Câmara dos Delegados e a Suprema Corte. Era para ser simples, conservador e adequado às condições climáticas da ilha. 134 projetos arquitetônicos foram enviados dos Estados Unidos, Cuba, Canadá, França, Espanha e Porto Rico.

A avaliação de as propostas ficaram a cargo de William F. Willoughby (presidente do Conselho Executivo), José de Diego (Presidente da Câmara, representado por Luis Muñoz Rivera), José S. Quiñones (Presidente do Supremo Tribunal Federal) e Laurence Grahame. Três arquitetos americanos também foram convidados a fazer parte da comissão: EB Homerde, John E. Howe e Bowen Bancroft Smith. No final, três projetos foram selecionados, pertencentes a Frank E. Perkins (Nova York), James H. Ritchie e Lewis B. Abbot (Boston) e Henry L. Beadle (Nova York).

Finalmente, o projeto escolhido foi o de Frank E. Perkins, que apresentava um estilo neoclássico com pouca ornamentação. Os salões principais eram organizados em torno de um logradouro central, com a fachada sul conduzindo ao hall de entrada. O saguão tinha a cúpula acima, que ostentava um estilo semelhante ao Panteão de Roma, incluindo o óculo. À direita, haveria uma sala de sessões para o Conselho Executivo e à esquerda para a Casa de Delegados. A Suprema Corte se reuniria em um salão voltado para o norte.

No entanto, Luis Muñoz Rivera e a imprensa local preferiram outro projeto que foi desqualificado pela comissão avaliadora, pois o arquiteto havia incluído um slogan nas plantas, o que era proibido. O projeto pertenceu a um engenheiro porto-riquenho chamado Carlos del Valle Zeno. O projeto de Del Valle apresentava um estilo renascentista, com ordens neoclássicas.

Apesar da opinião pública, Perkins foi contratado para fazer as plantas da construção do Capitólio, que foram leiloadas. Só em 1920 foi que o O projeto foi retomado quando o Comissário do Interior, Guillermo Esteves, publicou um novo desenho. A mudança veio após uma revisão do Departamento de Interior, que considerou o projeto de Perkins “inadequado. Com a supervisão dos arquitetos Adrian C. Finlayson, Francisco Roldán e Pedro de Castro, novos projetos foram feitos usando o estilo renascentista.

A construção do edifício acabou por começar em 1921 sob a liderança de Antonio R. Barceló. No entanto, a construção foi interrompida após a conclusão do primeiro nível. Quando Finlayson adoeceu, foi substituído por Rafael Carmoega que, juntamente com arquitetos Joseph O “Kelly, William Schimmelpfennig, Harry Pembleton, Albert Nichols, Luis F. Pina e Gonzalo Fernós Maldonado fizeram outro projeto para finalizar a estrutura.

Seu projeto incorporou alguns dos elementos de Perkins” s projeto original, incluindo a cúpula. O modelo da estrutura central e da cúpula era o da Biblioteca Low Memorial da Universidade de Columbia.

O prédio foi inaugurado em 11 de fevereiro de 1929, com a primeira reunião do Legislativo ive Assembleia ocorrendo três dias depois.

Ela foi listada no Registro Nacional de Locais Históricos dos Estados Unidos em 1977 como El Capitolio de Puerto Rico.