Voormalig gebouw van de Royal Treasury (Real Intendencia), nu het Departement van Puerto Rico van de staat.
Voorafgaand aan de oprichting van het Capitool gebruikte de Wetgevende Vergadering het gebouw van de provinciale delegatie, dat nu het ministerie van Buitenlandse Zaken huisvest. Het idee om een hoofdstad te bouwen werd voor het eerst geïntroduceerd door de voormalige resident-commissaris Luis Muñoz Rivera in 1907, en was gedeeltelijk bedoeld om een zekere mate van burgerregering op het eiland, dat op dat moment een kolonie van de Verenigde Staten was, te demonstreren. Het door Muñoz Rivera voorgestelde project kende $ 3 miljoen toe voor de bouw en stelde regels vast voor een wedstrijd tussen architecturen om te beslissen welke het werk zou doen.
In september 1907 stuurde Commissaris van Binnenlandse Zaken Laurence Grahame het officiële verzoek voor architecten via de pers en tijdschriften van de Verenigde Staten. De specificaties voor het gebouw waren dat het drie hoofdinstallaties moest hebben: de Uitvoerende Raad, het Huis van Afgevaardigden en het Hooggerechtshof. Het moest eenvoudig, conservatief en passend zijn voor de weersomstandigheden van het eiland. 134 architectonische ontwerpen werden ingediend vanuit de VS, Cuba, Canada, Frankrijk, Spanje en Puerto Rico.
De evaluatie van de voorstellen waren onder leiding van William F. Willoughby (voorzitter van de Uitvoerende Raad), José de Diego (voorzitter van het Huis, vertegenwoordigd door Luis Muñoz Rivera), José S. Quiñones (voorzitter van het Hooggerechtshof) en Laurence Grahame. Drie Amerikaanse architecten werden ook gevraagd om zich bij de commissie aan te sluiten: EB Homerde, John E. Howe en Bowen Bancroft Smith. Uiteindelijk werden drie projecten geselecteerd, van Frank E. Perkins (New York City), James H. Ritchie en Lewis B. Abbot (Boston) en Henry L. Beadle (New York).
Perkins-ontwerp
Ten slotte werd gekozen voor het project van Frank E. Perkins, dat een neoklassieke stijl presenteerde met weinig versieringen. De belangrijkste zalen waren georganiseerd rond een centrale patio, met de zuidgevel die leidt naar de lobby. De lobby had de koepel erboven, die een stijl droeg die leek op het Pantheon in Rome, inclusief de oculus. Aan de rechterkant zou er een vergaderzaal zijn voor de Uitvoerende Raad, en aan de linkerkant voor het Huis van Afgevaardigden. Het Hooggerechtshof zou bijeenkomen in een zaal die op het noorden is gericht.
Carlos del Valle Zeno-ontwerp
Luis Muñoz Rivera en de lokale pers gaven echter de voorkeur aan een ander project dat werd gediskwalificeerd door de beoordelingscommissie, omdat de architect een slogan in de blauwdrukken had opgenomen, wat verboden was. Het project was van een Puerto Ricaanse ingenieur genaamd Carlos del Valle Zeno. Del Valle’s project had een renaissancestijl, met neoklassieke orden.
Ondanks de publieke opinie werd Perkins ingehuurd om de bouwtekeningen voor het Capitool te maken, die vervolgens werden geveild. Het duurde tot 1920 voordat het project werd hernomen toen de commissaris van Binnenlandse Zaken, Guillermo Esteves, een nieuw ontwerp publiceerde. De verandering kwam na een herziening door het ministerie van Binnenlandse Zaken, die vond dat het ontwerp van Perkins ongepast was. Onder supervisie van de architecten Adrian C. Finlayson, Francisco Roldán en Pedro de Castro werden nieuwe blauwdrukken gemaakt in renaissancestijl.
De bouw van het gebouw begon uiteindelijk in 1921 onder leiding van Antonio R. Barceló. De bouw werd echter stopgezet na voltooiing van het eerste niveau. Toen Finlayson ziek werd, werd hij vervangen door Rafael Carmoega die, samen met architecten Joseph O “Kelly, William Schimmelpfennig, Harry Pembleton, Albert Nichols, Luis F. Pina en Gonzalo Fernós Maldonado maakten een ander ontwerp om de structuur af te werken.
In hun ontwerp waren enkele elementen uit Perkins origineel ontwerp, inclusief de koepel. Het model voor de centrale structuur en de koepel was dat van de Low Memorial Library van Columbia University.
Het gebouw werd ingehuldigd op 11 februari 1929, met de eerste bijeenkomst van de Wettelijk ive Assembly vindt drie dagen later plaats.
Het werd in 1977 vermeld in het Amerikaanse nationale register van historische plaatsen als El Capitolio de Puerto Rico.