Den første presidenten i Egypt var Mohamed Naguib, en av lederne for Free Officers Movement som ledet den egyptiske revolusjonen i 1952, og som tiltrådte 18. juni 1953, dagen da Egypt ble erklært republikk. Siden den gang har kontoret hatt fem andre personer: Gamal Abdel Nasser, Anwar Sadat, Hosni Mubarak, Mohamed Morsi og Abdel Fattah el-Sisi. I tillegg fungerte Sufi Abu Taleb som president mellom Sadats attentat og valget av hans etterfølger, og Adly Mansour opptrådte som president etter at Morsi ble styrtet i kuppet av etat i 2013.

Etter Hosni Mubarak «avgang 11. februar 2011 i den egyptiske revolusjonen i 2011, var kontoret ledig, med funksjonene som statsoverhode og regjeringssjef ble avskjediget av formannen for det øverste styret for væpnede styrker, feltmarskal Mohamed Hussein Tantawi.

Mohamed Morsi tiltrådte 30. juni 2012, etter å ha blitt valgt av presidentvalget 23. – 24. mai og 16. – 17. juni 2012. Han ble avsatt av de egyptiske væpnede styrkene i et statskupp. 3. juli 2013, etter massive protester som ba om hans avgang. Han ble etterfulgt av Adly Mansour, lederen av den høyeste konstitusjonelle domstolen i Egypt, som fungerende president. Mansour ble sverget til vervet foran den høyeste konstitusjonelle domstolen 4. juli 2013 .

Nåværende president el-Sisi tiltrådte 8. juni 2014, etter å ha blitt valgt av presidentvalget 26. til 28. mai 2014. Han ble gjenvalgt av presidentvalget 26. til 28. mars 2018.