Biskoppenes krig og parlamentets tilbakevending (1640–42)
Hendelseskiftet i Skottland forferdet Charles, som bestemte seg for å bringe de opprørske skottene til hæl. Imidlertid overveldet Covenanters, som de skotske opprørerne ble kjent, raskt den dårlig trente engelske hæren og tvang kongen til å undertegne en fredsavtale i Berwick (18. juni 1639). Selv om Covenanters hadde vunnet den første biskopekrigen, nektet Charles å innrømme seier og ringte til et engelsk parlament, og så på det som den eneste måten å skaffe penger raskt. Parlamentet samlet i april 1640, men det varte bare i tre uker (og ble derfor kjent som det korte parlamentet). Underhuset var villig til å stemme de enorme beløpene som kongen trengte for å finansiere krigen mot skotten, men ikke før deres klager – noen dateres mer enn et tiår tilbake – har blitt oppklart. Rasende oppløste Charles det korte parlamentet raskt. Som et resultat var det en utrent, dårlig bevæpnet og dårlig betalt styrke som slepte nordover for å kjempe mot skotten i den andre biskopekrigen. 20. august 1640 invaderte Covenanters England for andre gang, og i en spektakulær militærkampanje tok de Newcastle etter slaget ved Newburn (28. august). Demoralisert og ydmyket hadde kongen ikke noe annet alternativ enn å forhandle, og på skotske insistering, å huske parlamentet. Abonner nå
Et nytt parlament (det lange parlamentet), som ingen drømte om å sitte i de neste 20 årene, samlet seg i Westminster 3. november 1640 og ba umiddelbart om anklagelse av Wentworth, som nå var jarlen til Strafford. Den langvarige rettssaken i Westminster, som endte med Straffords henrettelse 12. mai 1641, ble orkestrert av protestanter og katolikker fra Irland, av Scottish Covenanters, og av kongens engelske motstandere, spesielt lederen av Commons, John Pym – og understreket effektivt viktigheten av forbindelsene mellom alle Stuart-kongedømmene i dette kritiske veikrysset.
I noen grad lette fjerningen av Straffords drakoniske hånd utbruddet av Ulsteropprøret i Irland i oktober 1641. Dette opprøret stammer på den ene siden fra langsiktige sosiale, religiøse og økonomiske årsaker (nemlig tenurial usikkerhet, økonomisk ustabilitet, gjeld og et ønske om å få den romersk-katolske kirken tilbake til sin posisjon før reformasjonen) og derimot fra kortsiktige politiske faktorer som utløste voldsutbrudd. Uunngåelig fulgte blodsutgytelse og unødvendig grusomhet opprøret, som raskt oppslukte øya og tok form av en populær stigende, grov katolsk innfødt mot protestantiske nykommere. Omfanget av «massakren» på protestanter var overdrevet, særlig i England hvor de villeste ryktene lett ble trodd. Kanskje mistet 4000 bosettere livet – en tragedie for å være sikker, men langt fra tallet på 154.000 den irske regjeringen foreslo at blitt mer slaktet. Mye mer vanlig var plyndring og plyndring av protestantisk eiendom og tyveri av husdyr. Disse menneskelige og materielle tapene ble replikert på den katolske siden da protestantene gjengjeldte. krise i England, mens Charles og hans Westminster-parlament argumenterte for hvem av dem som skulle kontrollere hæren som skulle reises for å dempe de irske opprørerne. Hadde Charles godtatt listen over klager som ble presentert av parlamentet i Grand Remonstrance i desember 1641 og på en eller annen måte forsonet deres ulikheter, ville opprøret i Irland nesten helt sikkert blitt opphørt med relativt letthet. I stedet mobiliserte Charles på egenhånd for krig, r aising sin standard på Nottingham i august 1642. Wars of the Three Kingdoms hadde startet for alvor. Dette markerte også starten på den første engelske borgerkrigen som ble utkjempet mellom tropper mot Charles I og de som tjente parlamentet. Etter en periode med falsk krig sent i 1642, var den grunnleggende formen for den engelske borgerkrigen av royalistisk fremgang i 1643 og deretter jevn parlamentarisk slitasje og utvidelse.