Vor der Errichtung des Kapitols nutzte die gesetzgebende Versammlung das Delegationsgebäude der Provinz, in dem sich heute das Außenministerium befindet. Die Idee, eine Hauptstadt zu errichten, wurde erstmals 1907 vom ehemaligen Kommissar Luis Muñoz Rivera eingeführt und sollte teilweise ein gewisses Maß an ziviler Herrschaft auf der Insel demonstrieren, die zu dieser Zeit eine Kolonie der Vereinigten Staaten war. Das von Muñoz Rivera vorgeschlagene Projekt stellte 3 Millionen US-Dollar für den Bau bereit und legte Regeln für einen Wettbewerb zwischen Architekturen fest, um zu entscheiden, welche die Arbeiten ausführen würden.

Im September 1907 sandte der Innenkommissar Laurence Grahame die offizielle Anfrage für Architekten durch die Presse und Zeitschriften der Vereinigten Staaten. Die Spezifikationen für das Gebäude lauteten, dass es drei Hauptinstallationen haben sollte: den Exekutivrat, das Abgeordnetenhaus und den Obersten Gerichtshof. Es sollte einfach, konservativ und den Wetterbedingungen der Insel angemessen sein. 134 Architekturentwürfe wurden aus den USA, Kuba, Kanada, Frankreich, Spanien und Puerto Rico eingereicht.

Die Bewertung von Die Vorschläge waren verantwortlich für William F. Willoughby (Präsident des Exekutivrates), José de Diego (Sprecher des Hauses, vertreten durch Luis Muñoz Rivera), José S. Quiñones (Präsident des Obersten Gerichtshofs) und Laurence Grahame. Drei amerikanische Architekten wurden ebenfalls gebeten, sich dem Auftrag anzuschließen: EB Homerde, John E. Howe und Bowen Bancroft Smith. Am Ende wurden drei Projekte ausgewählt, die Frank E. Perkins (New York City), James H. Ritchie und Lewis B. Abbot (Boston) und Henry L. Beadle (New York).

Schließlich wurde das Projekt von Frank E. Perkins ausgewählt, das einen neoklassizistischen Stil mit wenig Ornamentik präsentierte. Die Haupthallen waren um ein zentrale Terrasse, mit der Südfassade zur Lobby. In der Lobby befand sich oben die Kuppel, die einen ähnlichen Stil wie das Pantheon in Rom hatte, einschließlich des Okulus. Rechts wäre ein Sitzungssaal für den Exekutivrat und links ein Sitzungssaal für das Abgeordnetenhaus. Der Oberste Gerichtshof würde sich in einer nach Norden ausgerichteten Halle treffen.

Luis Muñoz Rivera und die lokale Presse bevorzugten jedoch ein anderes Projekt, das vom Bewertungsausschuss disqualifiziert wurde, da der Architekt einen Slogan in die Blaupausen aufgenommen hatte, der verboten war. Das Projekt gehörte einem puertoricanischen Ingenieur namens Carlos del Valle Zeno. Del Valles Projekt präsentierte einen Renaissance-Stil mit neoklassizistischen Orden.

Trotz der öffentlichen Meinung wurde Perkins beauftragt, die Baupläne für das Kapitol zu erstellen, die dann versteigert wurden. Erst 1920 wurde das Das Projekt wurde wiederholt, als der Innenkommissar Guillermo Esteves einen neuen Entwurf veröffentlichte. Die Änderung erfolgte nach einer Überarbeitung durch das Innenministerium, die Perkins „Design als unangemessen empfand. Unter der Aufsicht der Architekten Adrian C. Finlayson, Francisco Roldán und Pedro de Castro wurden neue Entwürfe im Renaissancestil angefertigt.

Der Bau des Gebäudes begann schließlich 1921 unter der Leitung von Antonio R. Barceló. Der Bau wurde jedoch nach Abschluss der ersten Ebene eingestellt. Als Finlayson krank wurde, wurde er durch Rafael Carmoega ersetzt, der zusammen mit Architekten Joseph O. Kelly, William Schimmelpfennig, Harry Pembleton, Albert Nichols, Luis F. Pina und Gonzalo Fernós Maldonado haben ein anderes Design entworfen, um die Struktur fertigzustellen.

Ihr Design enthielt einige der Elemente von Perkins Originalentwurf, einschließlich der Kuppel. Das Modell für die zentrale Struktur und die Kuppel war das der Low Memorial Library an der Columbia University.

Das Gebäude wurde am 11. Februar 1929 mit dem ersten Treffen der Gesetzgebung Die Versammlung fand drei Tage später statt.

Sie wurde 1977 im US-amerikanischen National Register of Historic Places als El Capitolio de Puerto Rico eingetragen.