A püspöki háborúk és a Parlament visszatérése (1640–42)
Az események fordulata Skóciában szörnyülködött Charles, aki elhatározta, hogy a lázadó skótokat sarkára viszi. A szövetségek azonban, amint a skót lázadók ismertté váltak, gyorsan elárasztották a rosszul kiképzett angol hadsereget, és arra kényszerítették a királyt, hogy írjon alá békeszerződést Berwickben (1639. június 18.). Noha a Covenanterek megnyerték az első püspöki háborút, Charles nem volt hajlandó elismerni a győzelmet, és egy angol parlamentet hívott össze, mivel ez az egyetlen módja a pénz gyors előteremtésének. A Parlament 1640 áprilisában gyűlt össze, de csak három hétig tartott (és ezért rövid parlament néven vált ismertté). Az alsóház hajlandó volt megszavazni azokat az óriási összegeket, amelyekre a királynak szüksége volt a skótok elleni háború finanszírozásához, de mindaddig, amíg az ő panaszaikat – amelyek több mint egy évtizede nyúltak vissza – nem orvosoltak. Dühödten Charles gyorsan feloszlatta a rövid parlamentet. Ennek eredményeként egy képzetlen, rosszul felfegyverzett és rosszul fizetett erő volt észak felé vonulva, hogy a skótok ellen harcoljon a második püspöki háborúban. 1640. augusztus 20-án a szövetségek másodszor is betörtek Angliába, és egy látványos katonai hadjárat során Newcastle-i csatát követően (augusztus 28.) vitték el Newcastle-t. Demoralizálva és megalázva a királynak nem volt más választása, mint tárgyalni, és a skótok ragaszkodására visszahívni a parlamentet.
Egy új parlament (a Hosszú Parlament), amelyet senki sem álmodott meg a következő 20 évben, 1640. november 3-án gyűlt össze Westminsterben, és azonnal felszólította a Wentworth, aki mostanáig Strafford grófja volt. Az 1641. május 12-én Strafford kivégzésével végződő Westminsterben tartott hosszadalmas tárgyalást az ír protestánsok és katolikusok, a skót szövetségek és a király angol ellenfelei, különösen a Commons vezetője, John Pym szervezték. az összes Stuart királyság közötti kapcsolat ebben a kritikus csomópontban.
Bizonyos mértékben Strafford drákói kezének eltávolítása megkönnyítette az írországi Ulster-felkelés kitörését 1641 októberében. Ez a lázadás egyrészt hosszú távú társadalmi, vallási és gazdasági okokból ered (nevezetesen a tenurális bizonytalanságból, a gazdasági instabilitásból, az eladósodásból és a vágyból, hogy a római katolikus egyház helyreálljon a reformot megelőző helyzetében), és másrészt az erőszak kitörését kiváltó rövid távú politikai tényezőktől. Óhatatlanul vérontás és felesleges kegyetlenség kísérte a felkelést, amely gyorsan elnyelte a szigetet, és egy népszerű felemelkedés alakját öltött, amely katolikus bennszülötteket állított szembe a protestáns jövevényekkel. A protestánsok “mészárlásának” mértéke eltúlzott volt, különösen Angliában, ahol a legvadabb pletykákról hittek. Talán 4000 telepes vesztette életét – ez biztos tragédia, de az ír kormány által javasolt 154 000-es számtól messze van Sokkal gyakoribb volt a protestáns vagyonok kifosztása és kifosztása, valamint az állatlopás. Ezeket az emberi és anyagi veszteségeket a katolikus oldalon megismételték, amikor a protestánsok megtorolták.
Az ír felkelés azonnal politikai válságot váltott ki. válság Angliában, mivel Charles és Westminsteri parlamentje azon vitatkozott, hogy melyiküknek kellene irányítania a hadsereget, amelyet fel kell emelni az ír felkelők elfojtására. Ha Károly elfogadta volna a Parlament által az 1641. decemberi nagy megújuláson bemutatott sérelmek listáját, és valahogy kibékült nézeteltéréseiket, az írországi lázadást szinte biztosan viszonylag könnyedén megsemmisítették volna, ehelyett Charles önállóan Nottinghamben, 1642 augusztusában színvonalának növelése. A három királyság háborúja komolyan megkezdődött. Ez egyben az első angol polgárháború kezdetét is jelentette, amely I. Károlyhoz hű erők és a Parlamentet szolgálók között folyt. Az 1642 végén elkövetett hamis háború után az angol polgárháború alapformája 1643-ban a rojalistikus előrelépés volt, majd a parlamenti képviselők egyenletes kikerülése és terjeszkedése volt.