Yleisesti uskotaan, että paikallisen, käsittelemättömän tai ”raakan” hunajan syöminen voi auttaa allergiaoireita altistamalla sinut säännöllisesti siitepölylle – toisin kuin allergiakuvien toiminta. Allergiainjektiot auttavat herkistämään siitepölyallergisia ihmisiä altistamalla heidät tietylle siitepölylle tai siitepölyseokselle, joka ruiskutetaan säännöllisin väliajoin. Tärkeä ero tässä on se, että siitepölymäärät allergiainjektioissa ovat tunnettuja ja kasvavat asteittain tietylle tasolle parhaan tuloksen saavuttamiseksi. Tutkimukset ovat osoittaneet, että allergiakuvat ovat erittäin tehokkaita kausiluonteisten allergiaoireiden vähentämisessä. Paikallinen, käsittelemätön hunaja sisältää pieniä määriä ympäristöstä peräisin olevaa siitepölyä. Hunajan siitepöly on lähinnä kukista, joista löytyy mehiläisiä (kukkasen siitepöly ei todennäköisesti aiheuta allergiaoireita), ja allergeenisista, ilmassa olevista puiden, ruohojen ja rikkaruohojen siitepölyistä (joita mehiläiset eivät pölyttäneet!). Siten allergeenisen siitepölyn määrä hunajalla on tyypillisesti hyvin pieni, koska mehiläiset eivät sisälly tarkoituksellisesti tähän siitepölyyn hunajaan. Tätä pidetään epäpuhtauksena, kuten mehiläisten osat, home itiöt, bakteerit ja muut ympäristön hiukkaset, jotka voivat olla löytyy hunajasta. (Kaupallinen käsittely näyttää poistavan suurimman osan siitepölystä ja epäpuhtauksista.) Ei ole tieteellistä näyttöä siitä, että paikallisen hunajan syöminen parantaisi kausiluonteisia allergioita. Yksi tutkimus julkaistiin vuonna 2002 julkaisussa Annals of Allergy, Asthma & Immunologia ei osoittanut eroa allergikoilla, jotka söivät paikallista hunajaa, kaupallisesti jalostettua hunajaa tai hunajamaustettua lumelääkettä. Ja harvoissa tapauksissa saattoi olla riski. Erittäin herkissä henkilöissä jalostamattoman hunajan nauttiminen voi johtaa välittömään allergiseen reaktioon, johon liittyy suu, kurkku tai iho – kuten kutina, nokkosihottuma tai turvotus – tai jopa anafylaksia. Tällaiset reaktiot voivat liittyä joko siitepölyn tai mehiläisten osan epäpuhtauksiin.
