Antibiootit saattavat heikentää ehkäisypillereiden (ehkäisyvalmisteiden) tehokkuutta. Ehkäisypillerit koostuvat hormoneista, jotka estävät naisten lisääntymisjärjestelmää valmistautumasta siittiöiden siemennykseen.
On raportoitu raskaudesta naisilla, jotka ovat ottaneet antibiootteja ehkäisypillereiden käytön aikana. Suhdetta ei ole tähän mennessä tutkittu riittävästi. Tämä voi johtua osittain siitä, että vapaaehtoisten naisten on vaikea saada pillereitä antibioottien kanssa nähdäkseen, tapahtuuko raskaus. Teoriassa muut lääkkeet saattavat muuttaa syntyvyyden säätelyhormonien aineenvaihduntaa ja veritasoja ja muuttaa siten niiden tehokkuutta.
On kuitenkin huomionarvoista, että antibiootteja, kuten rifampiinia, ampisilliinia, tetrasyliinejä ja griseofulviinia, on raportoitu aiheuttaa läpimurtoverenvuotoa ja kuukautiskierron häiriöitä naisilla, jotka käyttävät ehkäisypillereitä. Samanlaisia vaikutuksia on raportoitu naisilla, jotka käyttävät kohtauslääkkeitä fenytoiinia ja barbituraatteja.
On myös huomionarvoista, että ehkäisypillerit eivät kuitenkaan ole 100-prosenttisesti tehokkaita. naiset, jotka käyttävät ehkäisypillereitä keskustellakseen lääkäreiden kanssa uusien ehkäisyvälineiden käytöstä antibioottien käytön aikana raskauden optimaaliseen ehkäisyyn.