• 1 Introducción
• 2 Estructura
• 3 Función
• 4 Estructuras 3D de la transcriptasa inversa

Introducción

Transcriptasa inversa (RT) o ADN polimerasa dependiente de ARN transcribe ARN monocatenario en ADN bicatenario. La RT del VIH-1 proviene del virus de la inmunodeficiencia humana y es un heterodímero de las subcadenas P66 y P51. P15 es su dominio de ARNasa H. Hay dos tipos de inhibidores de la RT: los NNRTI son los inhibidores no nucleósidos y los NRTI son los inhibidores nucleósidos. Al ser la proteína que da nombre a los retrovirus, la transcriptasa inversa es, junto con la proteasa y la integrasa, la parte más importante del sistema proteico involucrado en el proceso de infección y reproducción de virus como el VIH, MuLV y AMV. RT tiene la propiedad inusual de transcribir ssRNA en dsDNA yendo en contra del Dogma Central de la Biología Molecular. Desde su descubrimiento en 1970, el estudio de sus propiedades y mecanismos de acción ha sido de gran interés entre la comunidad científica debido a las propiedades únicas que hace Es una enzima diana médica importante y una herramienta importante para aplicaciones de ingeniería genética como RT-PCR en la construcción de bibliotecas de ADNc. Consulte también

• Transcripción y procesamiento de ARN
• Transcriptasa inversa del VIH-1 en un complejo con nevirapina
• Phl p 2
• Transcriptasa inversa del VIH-1 resistente a AZT
• Subunidad catalítica de la polimerasa TERT de T. Castaneum.
• Telomerasa inversa Transcriptasa
• Transcriptasa inversa (hebreo)

La transcriptasa inversa es una de las moléculas CBI que se están estudiando en la interfaz de química y biología de Amherst de la Universidad de Massachusetts Programa en UMass Amherst (ver Transcriptasa inversa del VIH (UMass Chem 423 Student Projects 2011-2)) y en exhibición en Molecular Playground.

Estructura

Esta proteína similar a una mano tiene una longitud habitual de 1000 residuos (560 en la Cadena A (se muestra en rojo) y 440 para B (mostrado en verde)), un tercio de ellos involucrados en hélices alfa y casi un cuarto involucrados en láminas beta, mostrando dominios α + β. tiene un peso habitual de 66 KDa mientras que ronda los 51 KDa. Estos monómeros se derivan del mismo gen, pero p51 carece de los aminoácidos de un sitio activo y tiene una conformación de estructura terciaria diferente en comparación con p66. Debido a esto, p51 es enzimáticamente inactivo. Hay cinco estructuras distintas dentro de la subcadena p66 que se utilizan para describir las funciones de RT: los dedos (residuos 1-85 y 118-155), la palma (residuos 86-117 y 156). –236), el pulgar (residuos 237–318), la conexión (319–426) y la RNasa H (residuos 427-final). La palma contiene el sitio activo principal (residuos 110, 185-186).

Función

Como ARN -An polimerasa dependiente, la transcriptasa inversa es capaz de reconocer el ARN inicial, transcribirlo a ADNss, escindir el ARN restante y luego construir el ADNds. Para hacer esto, la proteína tiene dos zonas catalíticas activas. La cadena A tiene el que consta de dos dominios en forma de dedo: uno de ellos reconoce el ácido nucleico inicial mediante interacciones de enlace h con grupos fosfato de las cadenas laterales, luego ambos dominios realizan un cambio conformacional cerrando el orificio de reconocimiento para permitir el segundo dominio con el apoyo de un sistema de coordinación para iniciar el proceso de transcripción agregando los nucleótidos específicos del ADN. Este cambio está permitido por a entre los dos dominios anteriores; se utiliza como un sitio objetivo farmacéutico común para prevenir el cambio y, por lo tanto, inhibir la actividad. Esta zona es la única zona de la Cadena A que tiene aminoácidos no conservados, lo que le da al virus más resistencia a los medicamentos. Enlace a la base de datos de Consurf para la entrada de PDB: 1JLB.

A la misma velocidad que ocurre el proceso de polimerización, el otro sitio activo conocido como el ARN de escisión, liberando el ssDNA que vuelve a pasar por el sitio activo de la Polimerasa para convertirse en dsDNA (todo esto con un sistema coordinativo, que permite el reconocimiento no específico, solo con fosfatos). Finalmente, la Cadena B, a pesar de la secuencia de aminoácidos similar a la Cadena A, no tiene actividad enzimática; su función es posiblemente estabilizar e interactuar con ambos sitios activos variando la longitud entre ellos para sincronizar ambas funciones.

Esta es la idea más general del mecanismo de acción de la transcriptasa inversa; sin embargo, el proceso sigue sin estar claro y se están informando nuevos enfoques.

Uno de los principales problemas de esta proteína en comparación con la ADN polimerasa habitual (además de la similitud con el fragmento de Klenow) es la falta de un mecanismo de corrección (generalmente elaborado por ADN PolIII en la ADN polimerasa); esta deficiencia aumenta el número de errores, produciendo más mutaciones y, por tanto, dando más capacidad facultativa y de resistencia al virus.

Estructuras 3D de transcriptasa inversa

Estructuras 3D de transcriptasa inversa