El primer presidente de Egipto fue Mohamed Naguib, uno de los líderes del Movimiento de Oficiales Libres que dirigió la Revolución Egipcia de 1952, y que asumió el cargo el 18 de junio de 1953, el día en que Egipto fue declarado República. Desde entonces, el cargo ha estado ocupado por cinco personas más: Gamal Abdel Nasser, Anwar Sadat, Hosni Mubarak, Mohamed Morsi y Abdel Fattah el-Sisi. Además, Sufi Abu Taleb actuó como presidente entre el asesinato de Sadat y la elección de su sucesor, y Adly Mansour actuó como presidente después del derrocamiento de Morsi en el golpe de estado de 2013.
Después de Hosni Mubarak Tras su dimisión el 11 de febrero de 2011 en la Revolución egipcia de 2011, el cargo quedó vacante, y las funciones de jefe de estado y jefe de gobierno fueron asumidas por el presidente del Consejo Supremo de las Fuerzas Armadas, el mariscal de campo Mohamed Hussein Tantawi.
Mohamed Morsi asumió el cargo el 30 de junio de 2012, tras ser elegido en las elecciones presidenciales celebradas los días 23 y 24 de mayo y del 16 al 17 de junio de 2012. Fue depuesto por las Fuerzas Armadas de Egipto en un golpe de Estado. el 3 de julio de 2013, tras protestas masivas en las que se pedía su dimisión. Adly Mansour, jefe del Tribunal Constitucional Supremo de Egipto, lo sucedió como presidente interino. Mansour tomó posesión de su cargo ante el Tribunal Constitucional Supremo el 4 de julio de 2013 .
Presidente actual el-Sisi asumió el cargo el 8 de junio de 2014, después de ser elegido en las elecciones presidenciales celebradas del 26 al 28 de mayo de 2014. Fue reelegido en las elecciones presidenciales celebradas del 26 al 28 de marzo de 2018.