Den første præsident for Egypten var Mohamed Naguib, en af lederne af Free Officers Movement, der ledede den egyptiske revolution i 1952, og som tiltrådte den 18. juni 1953, den dag, hvor Egypten blev erklæret en republik. Siden da har kontoret været afholdt af yderligere fem personer: Gamal Abdel Nasser, Anwar Sadat, Hosni Mubarak, Mohamed Morsi og Abdel Fattah el-Sisi. Derudover fungerede Sufi Abu Taleb som præsident mellem Sadats mord og valget af hans efterfølger, og Adly Mansour fungerede som præsident efter Morsis væltning i statskuppet i 2013.

Efter Hosni Mubarak “fratræden den 11. februar 2011 i den egyptiske revolution i 2011, var kontoret ledigt, hvor funktionerne som statsoverhoved og regeringschef blev afskediget af formanden for det væbnede styrelses øverste råd, feltmarskal Mohamed Hussein Tantawi.

Mohamed Morsi tiltrådte den 30. juni 2012 efter at være blevet valgt ved præsidentvalget den 23. – 24. maj og den 16. – 17. juni 2012. Han blev afsat af de egyptiske væbnede styrker i et kup d ‘état den 3. juli 2013, efter massive protester, der krævede hans afskedigelse. Han blev efterfulgt af Adly Mansour, lederen af den højeste forfatningsdomstol i Egypten, som fungerende præsident. Mansour blev svoret til embedet foran den højeste forfatningsdomstol den 4. juli 2013 .

Nuværende præsident el-Sisi tiltrådte den 8. juni 2014 efter at være valgt ved præsidentvalget den 26. til 28. maj 2014. Han blev genvalgt ved præsidentvalget den 26. til 28. marts 2018.