2.3. Separation af gaskromatografi

Separation med GC sker inden for søjlen.
Prøven, der indeholder flere forbindelser, injiceres i søjlen sammen med den mobile fase. (I GC er den mobile fase en gas, der betegnes bærergas. Han bruges ofte.) Både prøven og den mobile fase bevæger sig gennem søjlen, men hastigheden af progression inden i søjlen varierer afhængigt af forbindelsen. Følgelig opstår forskelle i de tidspunkter, hvor de respektive forbindelser ankommer til søjleudløbet. Som et resultat opstår der en adskillelse mellem hver forbindelse.
Rækket af toppe, der trækkes, når de elektriske signaler, der sendes fra GC-detektoren, plottes på den lodrette akse, og den forløbne tid efter prøveinjektion plottes på den vandrette akse kaldes kromatogram.
Komponenterne, der passerer gennem søjlen, transporteres af den mobile fase (gasfase), mens de deles fra og adsorberes i den stationære fase (flydende fase og fast fase).

Her vises et typisk kromatogram.
Den vandrette akse viser tiden, indtil komponenten når detektoren. Den lodrette akse viser signalintensiteten.
Den del, hvor intet detekteres, kaldes basislinjen, og den del, hvor en komponent detekteres, kaldes en top.
Det tidspunkt, hvor prøven injiceres i systemet indtil toppene vises kaldes retentionstiden.
Da elueringstiderne for hver komponent er forskellige, kan hver komponent adskilles og detekteres.