Prvním egyptským prezidentem byl Mohamed Naguib, jeden z vůdců Hnutí svobodných důstojníků, kteří vedli egyptskou revoluci v roce 1952 a kteří se ujali funkce 18. června 1953, den, kdy byl Egypt prohlášen za republiku. Od té doby tuto kancelář zastává dalších pět lidí: Gamal Abdel Nasser, Anwar Sadat, Husní Mubarak, Mohamed Morsi a Abdel Fattah el-Sisi. Kromě toho Sufi Abu Taleb působil jako prezident mezi Sadatovým atentátem a zvolením jeho nástupce a Adly Mansour jako prezident po svržení Morsi v puči v roce 2013.

Po Husním Mubarakovi Při rezignaci dne 11. února 2011 v egyptské revoluci roku 2011 byl úřad prázdný a funkce hlavy státu a předsedy vlády byly vykonávány předsedou Nejvyšší rady ozbrojených sil polním maršálem Mohamedem Husajnem Tantawi.

Mohamed Morsi nastoupil do úřadu 30. června 2012, poté, co byl zvolen prezidentskými volbami konanými ve dnech 23. – 24. května a 16. – 17. června 2012. Byl sesazen egyptskými ozbrojenými silami při převratu dne 3. července 2013, po masivních protestech požadujících jeho rezignaci. Na jeho místo nastoupil Adly Mansour, šéf Nejvyššího ústavního soudu v Egyptě, jako úřadující prezident. Mansour složil přísahu do funkce před Nejvyšším ústavním soudem dne 4. července 2013 .

Současný prezident el-Sisi nastoupil do úřadu 8. června 2014 poté, co byl zvolen prezidentskými volbami konanými ve dnech 26. – 28. května 2014. Byl znovu zvolen prezidentskými volbami konanými ve dnech 26. – 28. března 2018.