Na řadě je John Pope
Druhá bitva o Bull Run proběhla mezi 28. srpna a 30. srpna 1862. Prezident Abraham Lincoln, zděšen výkonem velitele Unie Georgem B. McClellanem, umístil Johna Popea do vedení nově vytvořené armády Virginie. Papežská armáda Virginie se skládala ze tří sborů v celkovém objemu přibližně muži. Jejich účelem bylo chránit Washington a údolí Shenandoah a zajistit, aby byly síly Konfederace odkloněny od McClellanovy armády pochodem směrem do Gordonsville ve Virginii.
Lee Schemes
Robert E. Lee, protože si uvědomil, že dva hlavní orgány armády Unie byly rozděleny a mimo dosah sebe navzájem viděly příležitost rozdrtit papežovu armádu. Nejprve poslal armády generálů Stonewalla Jacksona a AP Hilla přímo na papežovu zásobovací linku – Orange and Alexandria Railroad, kde Jackson dohlížel na její zničení, než vpochodoval do Manassasu a zajal a zničil zásobovací sklad Unie. Tento šokující vývoj donutil papeže přesunul své jednotky ze svých obranných pozic a způsobil, že Jackson zaujal obranné pozice poblíž nedokončeného železničního stupně v blízkosti původního bojiště Bull Run. Druhá bitva o Bull Run začala 28. srpna, kdy Jackson zaútočil na kolonu Unie pochodující podél Warrenton Pike poblíž Gainesville ve Virginii. Žádná ze stran nezískala výhodu 28., ale divoké boje na krátkou vzdálenost vyústily v téměř 2 400 celkových obětí. Dva generálové Konfederace, včetně Richarda Ewella, byli těžce zraněni.
Ne, velitel papeži – Konfederace NESTUPUJÍ
Papež viděl výsledek prvního dne jako vítězství Unie a věřil, že Jackson ustupuje. nařídil útok na Jacksona pro 29., jehož armáda zaujala účinná obranná postavení a který měl být brzy posílen generálem Konfederace Jamesem Longstreetem a dalšími 25 000 vojáky. Zmatek v řadách Unie vedl k těžké nedorozumění a chybným informacím týkajícím se příchodu Longstreet. Kromě toho byly papežovy písemné rozkazy jeho generálům vágní a rozporuplné, což dále frustrovalo mobilizaci. Přesto se ve dne v noci 29. došlo k různým útokům a bitvám. Na konci noci papež stále věřil, že Konfederace budou v stav ústupu a nařídil masivní ofenzívu na 30. místo.
Konfederace čekali
Ráno 30. byly síly Konfederace v obranných pozicích v naději, že budou napadeny, aby mohl zahájit protiútok. Pope zahájil svou mohutnou ofenzívu do Jacksonovy armády krátce po poledni. Konfederační dělostřelectvo zdevastovalo síly Unie pod vedením Fitze Johna Portera, než zahájilo protiútok s 25 000 vojáky Longstreets, který se ukázal být největším masovým útokem ve válce, který zcela rozdrtil celé levé křídlo sil Unie a poslal je zpět do Bull Run Creek a nakonec podél Warrenton silnice na Centreville. Kvůli vyčerpání a temnotě Konfederace nepronásledovali, a ačkoli papež bitvu prohrál, jeho armáda nebyla úplně zničena.
Rozhodující vítězství Konfederace
Druhá (a mnohem větší) bitva o Bull Run byla rozhodujícím vítězstvím Konfederace. Unie utrpěla přes 10 000 obětí, zatímco Konfederace přes 7 000 obětí. Konfederační vítězství umožnilo Robertu E. Leeovi plánovat a uskutečnit kampaň v Marylandu. Papežovy výkony v bitvě ho stály jeho velení. Generálmajor Fitz John Porter byl před vojenským soudem za nedodržení papežových příkazů a byl z armády propuštěn.