Wojny biskupów i powrót parlamentu (1640–42)
Przełom wydarzeń w Szkocji przerażony Karol, który zdecydował się zmusić zbuntowanych Szkotów do walki. Jednak Covenanters, jak stali się znani szkoccy buntownicy, szybko pokonali słabo wyszkoloną armię angielską, zmuszając króla do podpisania traktatu pokojowego w Berwick (18 czerwca 1639). Chociaż Covenanters wygrali pierwszą wojnę biskupów, Karol odmówił przyznania zwycięstwa i zwołał parlament angielski, widząc w tym jedyny sposób na szybkie zebranie pieniędzy. Parlament zebrał się w kwietniu 1640 r., Ale trwał tylko trzy tygodnie (stąd stał się znany jako Krótki Parlament). Izba Gmin była gotowa przegłosować ogromne sumy, których król potrzebował, by sfinansować swoją wojnę ze Szkotami, ale dopiero po wyrównaniu ich skarg – niektórych sprzed ponad dekady. Wściekły Charles pospiesznie rozwiązał Short Parliament. W rezultacie była to niewyszkolona, źle uzbrojona i słabo opłacana siła, która podążyła na północ, by walczyć ze Szkotami w drugiej wojnie biskupów. 20 sierpnia 1640 r. Covenanters po raz drugi najechali Anglię i w spektakularnej kampanii wojskowej zdobyli Newcastle po bitwie pod Newburn (28 sierpnia). Zdemoralizowany i upokorzony król nie miał innego wyjścia, jak tylko negocjować i, pod naciskiem Szkotów, odwołać parlament.
Nowy parlament (Długi Parlament), o którym nikt nie marzył, będzie siedział przez następne 20 lat, zebrał się w Westminsterze 3 listopada 1640 roku i natychmiast wezwał do oskarżenia Wentworth, który był teraz hrabią Strafford. Długi proces w Westminster, zakończony egzekucją Strafforda 12 maja 1641 r., Został zaaranżowany przez protestantów i katolików z Irlandii, przez Scottish Covenanters oraz przez angielskich przeciwników króla, zwłaszcza przywódcę Commons, Johna Pyma – skutecznie podkreślając znaczenie połączenia między wszystkimi królestwami Stuartów na tym krytycznym skrzyżowaniu.
Do pewnego stopnia usunięcie drakońskiej ręki Strafforda ułatwiło wybuch powstania Ulsteru w Irlandii w październiku 1641 roku. Ten bunt wywodził się, z jednej strony, z długoterminowych przyczyn społecznych, religijnych i ekonomicznych (a mianowicie niepewności stałej, niestabilności ekonomicznej, zadłużenia i pragnienia przywrócenia Kościoła rzymskokatolickiego do pozycji sprzed reformacji), a także z drugiej strony, z krótkoterminowych czynników politycznych, które wywołały wybuch przemocy. Nieuchronnie rozlew krwi i niepotrzebne okrucieństwo towarzyszyły powstaniu, które szybko ogarnęło wyspę i przybrało formę ludowego powstania, stawiając katolickich tubylców przeciwko protestanckim przybyszom. Skala „masakry” protestantów była przesadzona, zwłaszcza w Anglii, gdzie chętnie wierzono w najdziksze pogłoski. Być może 4000 osadników straciło życie – z pewnością tragedia, ale daleko od liczby 154 000 sugerowanych przez irlandzki rząd znacznie częściej dochodziło do grabieży i grabieży własności protestanckiej oraz inwentarza żywego. Te straty ludzkie i materialne zostały powtórzone po stronie katolickiej, gdy protestanci wzięli odwet.
Powstanie irlandzkie natychmiast przyspieszyło polityczną kryzys w Anglii, kiedy Karol i jego parlament westminsterski spierali się, który z nich powinien kontrolować armię, która ma zostać powołana do stłumienia irlandzkich powstańców. Czy Karol przyjął listę skarg przedstawioną mu przez parlament w Wielkiej Remonstrance w grudniu 1641 r. i jakoś pogodził się z różnice, bunt w Irlandii prawie na pewno zostałby stłumiony ze względną łatwością. Zamiast tego Karol zmobilizował się do wojny na własną rękę, r podnosząc swój sztandar w Nottingham w sierpniu 1642 r. Wojny Trzech Królestw zaczęły się na dobre. To również oznaczało początek pierwszej angielskiej wojny domowej, toczonej między siłami lojalnymi wobec Karola I i tymi, którzy służyli Parlamentowi. Po okresie fałszywej wojny pod koniec 1642 r., Podstawowym kształtem angielskiej wojny domowej był postęp rojalistów w 1643 r., A następnie stały rozpad i ekspansja parlamentarna.