Pierwszym prezydentem Egiptu był Mohamed Naguib, jeden z przywódców Ruchu Wolnych Oficerów, który przewodził rewolucji egipskiej w 1952 roku i objął urząd 18 czerwca 1953 roku, dzień, w którym Egipt został ogłoszony Republiką. Od tego czasu urząd piastowało jeszcze pięć osób: Gamal Abdel Nasser, Anwar Sadat, Hosni Mubarak, Mohamed Morsi i Abdel Fattah el-Sisi. Ponadto Sufi Abu Taleb działał jako prezydent między zabójstwem Sadata a wyborem jego następcy, a Adly Mansour pełnił funkcję prezydenta po obaleniu Morsiego w zamachu stanu w 2013 roku.

W ślad za Hosni Mubarakiem „rezygnacji w dniu 11 lutego 2011 r. w czasie rewolucji egipskiej w 2011 r. stanowisko to było nieobsadzone, a funkcje głowy państwa i szefa rządu pełnił przewodniczący Rady Najwyższej Sił Zbrojnych, feldmarszałek Mohamed Hussein Tantawi.

Mohamed Morsi objął urząd 30 czerwca 2012 r. po tym, jak został wybrany w wyborach prezydenckich w dniach 23–24 maja i 16–17 czerwca 2012 r. Został zdetronizowany przez siły zbrojne Egiptu w zamachu stanu. 3 lipca 2013 r., po masowych protestach wzywających do jego rezygnacji. Zastąpił go Adly Mansour, prezes Najwyższego Sądu Konstytucyjnego Egiptu, na stanowisku prezydenta. Mansour został zaprzysiężony przed Najwyższym Trybunałem Konstytucyjnym 4 lipca 2013 r. .

Obecny prezydent el-Sisi objął urząd 8 czerwca 2014 r., po wyborze w wyborach prezydenckich, które odbyły się 26–28 maja 2014 r. Został ponownie wybrany w wyborach prezydenckich, które odbyły się 26–28 marca 2018 r.