De taken van het GOS zijn het coördineren van het beleid van de leden met betrekking tot hun economie, buitenlandse betrekkingen, defensie, immigratiebeleid, milieubescherming en wetshandhaving. Het hoogste regeringsorgaan is een raad die is samengesteld uit de staatshoofden (d.w.z. presidenten) en de regering (premiers) van de lidrepublieken, die worden bijgestaan door commissies van ministers van de republiek op belangrijke gebieden als economie en defensie. De leden van de GOS beloofden om zowel hun strijdkrachten als de voormalige Sovjet-kernwapens op hun grondgebied onder één verenigd commando te houden. In de praktijk bleek dit echter moeilijk, evenals de inspanningen van de leden om de introductie van marktmechanismen en particulier eigendom in hun respectieve economieën te coördineren.
In augustus 2008, na een escalatie van vijandelijkheden tussen Rusland en Georgië over de separatistische regio Zuid-Ossetië, kondigde Georgië zijn voornemen om zich terug te trekken uit het CIS. De terugtrekking werd in augustus 2009 afgerond. In 2014 brak in Oost-Oekraïne een soortgelijke proxyoorlog uit na de illegale annexatie door Rusland van de Oekraïense autonome republiek de Krim. In 2018 waren minstens 10.000 mensen omgekomen bij botsingen tussen Oekraïense strijdkrachten en door Rusland gesteunde paramilitaire eenheden in het Donetsbekken. In mei van dat jaar, Oekraïense Pres. Petro Poroshenko heeft het lidmaatschap van Oekraïne officieel uit het GOS ingetrokken.