Le funzioni del CIS sono di coordinare le politiche dei suoi membri riguardo alle loro economie, relazioni estere, difesa, politiche di immigrazione, protezione ambientale e forze dell’ordine. Il suo organo governativo superiore è un consiglio composto dai capi di stato (cioè i presidenti) e di governo (primi ministri) delle repubbliche membri, assistiti dai comitati dei ministri del gabinetto della repubblica in settori chiave come l’economia e la difesa. I membri della CSI si sono impegnati a mantenere le loro forze armate e le ex armi nucleari sovietiche di stanza sui loro territori sotto un unico comando unificato. In pratica, ciò si è rivelato difficile, tuttavia, così come gli sforzi dei membri per coordinare l’introduzione di meccanismi di mercato e di proprietà privata nelle rispettive economie.
Nell’agosto 2008, a seguito di un’escalation delle ostilità tra Russia e Georgia sulla regione separatista dell’Ossezia meridionale, la Georgia ha annunciato il suo intenzione di ritirarsi dalla CSI. Il ritiro è stato finalizzato nell’agosto 2009. Una simile guerra per procura è scoppiata nell’Ucraina orientale nel 2014 dopo l’annessione illegale da parte della Russia della Repubblica autonoma ucraina di Crimea. Nel 2018 almeno 10.000 persone erano state uccise negli scontri tra le forze armate ucraine e le unità paramilitari sostenute dalla Russia nel bacino del Donets. Nel maggio di quell’anno, il presidente ucraino. Petro Poroshenko ha ufficialmente ritirato l’adesione dell’Ucraina alla CSI.